More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1890 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  64.29 
 
 
585 aa  743    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  70.36 
 
 
587 aa  852    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  66.84 
 
 
604 aa  819    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  70.53 
 
 
586 aa  863    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  68.26 
 
 
583 aa  832    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  100 
 
 
586 aa  1197    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  71.33 
 
 
583 aa  835    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  42.62 
 
 
600 aa  498  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  41.83 
 
 
593 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  39.9 
 
 
592 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  41.39 
 
 
585 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  41.96 
 
 
596 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  41.41 
 
 
598 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  40.44 
 
 
591 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  41.07 
 
 
594 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  40.83 
 
 
593 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
578 aa  432  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  38.08 
 
 
588 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  38.74 
 
 
582 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 
611 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  38.05 
 
 
606 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  37.78 
 
 
589 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  36.86 
 
 
581 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  37.43 
 
 
569 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  38.51 
 
 
572 aa  395  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  36.96 
 
 
641 aa  393  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  38.38 
 
 
541 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  36.21 
 
 
581 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  37.43 
 
 
569 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  34.74 
 
 
618 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  37.37 
 
 
583 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  35.51 
 
 
579 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.61 
 
 
610 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  36.99 
 
 
603 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
581 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.44 
 
 
593 aa  364  2e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.8 
 
 
556 aa  362  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  37.15 
 
 
607 aa  362  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  34.42 
 
 
573 aa  361  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  37.36 
 
 
588 aa  356  7.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  34.19 
 
 
583 aa  353  4e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  35.99 
 
 
607 aa  353  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  32.94 
 
 
577 aa  352  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  32.76 
 
 
583 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  37.12 
 
 
641 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.88 
 
 
598 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  33.1 
 
 
589 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  35.73 
 
 
650 aa  347  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  32.94 
 
 
577 aa  347  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  33.73 
 
 
600 aa  343  4e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.37 
 
 
583 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.54 
 
 
583 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  35.05 
 
 
588 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.05 
 
 
555 aa  342  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  34.94 
 
 
580 aa  340  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  33.92 
 
 
574 aa  340  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  33.92 
 
 
574 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  33.1 
 
 
598 aa  339  7e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.39 
 
 
581 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  32.03 
 
 
583 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  33.39 
 
 
590 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  32.03 
 
 
583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  32.03 
 
 
583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.03 
 
 
583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.03 
 
 
583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  32.03 
 
 
583 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  34.55 
 
 
584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  33.68 
 
 
575 aa  336  9e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.27 
 
 
598 aa  335  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 
604 aa  335  2e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  32.58 
 
 
581 aa  335  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.85 
 
 
583 aa  334  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.85 
 
 
583 aa  334  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.89 
 
 
575 aa  334  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  32.4 
 
 
598 aa  333  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.89 
 
 
596 aa  331  2e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  33.1 
 
 
579 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  34.02 
 
 
583 aa  330  6e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  32.53 
 
 
586 aa  329  8e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  31.92 
 
 
573 aa  329  8e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  33.5 
 
 
591 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  36.2 
 
 
578 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  36.82 
 
 
598 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  34.19 
 
 
596 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0818  ABC transporter related  38.23 
 
 
569 aa  328  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153053  normal  0.572134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.2 
 
 
586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.07 
 
 
586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  37.5 
 
 
589 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  32.36 
 
 
586 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.9 
 
 
588 aa  327  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  33.85 
 
 
583 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.14 
 
 
590 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  30.17 
 
 
627 aa  327  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.93 
 
 
619 aa  327  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.99 
 
 
586 aa  327  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.36 
 
 
586 aa  327  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.99 
 
 
586 aa  327  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.68 
 
 
617 aa  326  7e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.36 
 
 
586 aa  326  7e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  33.45 
 
 
581 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>