More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0495 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  59.93 
 
 
583 aa  669    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  100 
 
 
603 aa  1208    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  87.02 
 
 
607 aa  961    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  42.29 
 
 
591 aa  487  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
588 aa  477  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  39.93 
 
 
611 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  38.22 
 
 
582 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  38.22 
 
 
583 aa  415  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  38.45 
 
 
569 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  37.25 
 
 
589 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.64 
 
 
610 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  38.89 
 
 
600 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  40.22 
 
 
541 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  38.51 
 
 
578 aa  405  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  38.97 
 
 
569 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  38.81 
 
 
572 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  35.21 
 
 
585 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  36.99 
 
 
593 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  36.94 
 
 
587 aa  395  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  36.58 
 
 
586 aa  395  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  37.61 
 
 
583 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  36.11 
 
 
598 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  37.71 
 
 
604 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  38.33 
 
 
598 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 
585 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  36.85 
 
 
641 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  37 
 
 
586 aa  389  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3127  ABC transporter related  41.57 
 
 
584 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  37.94 
 
 
596 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  35.5 
 
 
593 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  35.42 
 
 
581 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.39 
 
 
581 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  32.57 
 
 
592 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0283  ABC transporter related protein  39.12 
 
 
604 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  35.03 
 
 
589 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  35.28 
 
 
581 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  40.77 
 
 
642 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  36.87 
 
 
579 aa  365  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  34 
 
 
583 aa  362  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  36.69 
 
 
650 aa  359  8e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  33.5 
 
 
606 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  33.55 
 
 
586 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  34.34 
 
 
573 aa  357  2.9999999999999997e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  33.23 
 
 
618 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  33.28 
 
 
573 aa  355  1e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 
583 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  39.61 
 
 
580 aa  355  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.39 
 
 
586 aa  353  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.22 
 
 
586 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  32.46 
 
 
594 aa  352  8e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 
583 aa  352  8e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  33.17 
 
 
580 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
579 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  33.39 
 
 
584 aa  352  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.22 
 
 
586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.22 
 
 
586 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.61 
 
 
586 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.06 
 
 
581 aa  351  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.06 
 
 
586 aa  350  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.09 
 
 
601 aa  350  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  33.06 
 
 
586 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.06 
 
 
586 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  33.28 
 
 
583 aa  349  8e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.28 
 
 
583 aa  349  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.28 
 
 
583 aa  349  8e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.11 
 
 
583 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
581 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.33 
 
 
583 aa  347  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38.84 
 
 
606 aa  347  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  32.43 
 
 
583 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.39 
 
 
588 aa  345  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  38.39 
 
 
641 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.56 
 
 
593 aa  342  1e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.85 
 
 
555 aa  342  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  32.78 
 
 
583 aa  341  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  33.11 
 
 
583 aa  340  4e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  32.44 
 
 
577 aa  340  4e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 
583 aa  340  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  38.19 
 
 
589 aa  339  9e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  33.45 
 
 
588 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  33.77 
 
 
581 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  32.45 
 
 
578 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.28 
 
 
583 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.57 
 
 
573 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  34.64 
 
 
627 aa  336  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  33.79 
 
 
581 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  32.04 
 
 
577 aa  333  5e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.61 
 
 
594 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 
548 aa  332  9e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  33.5 
 
 
571 aa  332  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  35.73 
 
 
588 aa  332  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  32.55 
 
 
583 aa  332  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  35.77 
 
 
588 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  34.28 
 
 
782 aa  330  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  33.95 
 
 
588 aa  330  5.0000000000000004e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.28 
 
 
586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  33.77 
 
 
595 aa  327  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  31.36 
 
 
597 aa  326  8.000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  35 
 
 
607 aa  326  9e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  33.39 
 
 
600 aa  324  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>