More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12933 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  55.09 
 
 		 581 aa  658    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  100 
 
 		 585 aa  1185    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  64.47 
 
 		 592 aa  784    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  52.11 
 
 		 596 aa  610  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  49.83 
 
 		 593 aa  598  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  48.4 
 
 		 594 aa  579  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  49.24 
 
 		 593 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  49.66 
 
 		 598 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  43.2 
 
 		 606 aa  512  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  42.14 
 
 		 600 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  42.16 
 
 		 587 aa  483  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  43.05 
 
 		 583 aa  484  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  41.39 
 
 		 586 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  40.8 
 
 		 586 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  41.08 
 
 		 604 aa  458  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 		 591 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  42.57 
 
 		 585 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  41.09 
 
 		 582 aa  438  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  40.84 
 
 		 583 aa  425  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  40 
 
 		 589 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 		 611 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  42.89 
 
 		 588 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  37.78 
 
 		 578 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  35.34 
 
 		 579 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  37.08 
 
 		 618 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.22 
 
 		 583 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.05 
 
 		 583 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  38.56 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  36.54 
 
 		 583 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  36.54 
 
 		 583 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  36.54 
 
 		 583 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  35.8 
 
 		 589 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.36 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.54 
 
 		 583 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  36.19 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.54 
 
 		 583 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.88 
 
 		 583 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.22 
 
 		 589 aa  382  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  37.1 
 
 		 572 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.72 
 
 		 590 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.88 
 
 		 588 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.99 
 
 		 590 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  34.72 
 
 		 590 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  35.28 
 
 		 603 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  34.84 
 
 		 598 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  34.54 
 
 		 590 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.14 
 
 		 610 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.54 
 
 		 590 aa  372  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  38.42 
 
 		 583 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.54 
 
 		 590 aa  372  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.54 
 
 		 590 aa  372  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  35.86 
 
 		 573 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.31 
 
 		 588 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.02 
 
 		 591 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  36.48 
 
 		 641 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.2 
 
 		 590 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.13 
 
 		 588 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  37.74 
 
 		 604 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.48 
 
 		 588 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  36.29 
 
 		 569 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  34.25 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.25 
 
 		 586 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0563  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.96 
 
 		 590 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  34.25 
 
 		 586 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0500  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.96 
 
 		 590 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0503  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.96 
 
 		 590 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  35.2 
 
 		 650 aa  364  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0519  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.96 
 
 		 590 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0509  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.96 
 
 		 590 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.726436 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.9 
 
 		 586 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  35.24 
 
 		 581 aa  363  6e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.08 
 
 		 586 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  34.08 
 
 		 586 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.9 
 
 		 586 aa  362  9e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  33.9 
 
 		 586 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  33.96 
 
 		 584 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.9 
 
 		 586 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.7 
 
 		 555 aa  360  5e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.38 
 
 		 593 aa  359  9e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.49 
 
 		 581 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.28 
 
 		 590 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  35.65 
 
 		 588 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  35.78 
 
 		 588 aa  358  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.28 
 
 		 548 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  35.86 
 
 		 581 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.2 
 
 		 598 aa  357  3.9999999999999996e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 		 588 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  36.64 
 
 		 590 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  33.33 
 
 		 577 aa  350  4e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.75 
 
 		 598 aa  348  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  32.93 
 
 		 577 aa  345  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  36.4 
 
 		 607 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  32.77 
 
 		 580 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  37.88 
 
 		 642 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.85 
 
 		 556 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  37.67 
 
 		 573 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.01 
 
 		 588 aa  343  4e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>