More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5496 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  100 
 
 		 598 aa  1221    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  49.41 
 
 		 593 aa  611  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  52.11 
 
 		 593 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  51.94 
 
 		 596 aa  607  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  47.82 
 
 		 592 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  49.66 
 
 		 585 aa  570  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  44.84 
 
 		 606 aa  531  1e-149  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  44.39 
 
 		 600 aa  528  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  45.39 
 
 		 594 aa  524  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  46.35 
 
 		 581 aa  500  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  41.96 
 
 		 583 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  41.41 
 
 		 586 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  40.6 
 
 		 587 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  39.73 
 
 		 586 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  40.33 
 
 		 604 aa  445  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 588 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  39.9 
 
 		 591 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  40.7 
 
 		 585 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  38.85 
 
 		 582 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  40.44 
 
 		 583 aa  425  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  36.39 
 
 		 589 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  35.75 
 
 		 611 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  37.12 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 578 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  38.89 
 
 		 541 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  35.25 
 
 		 583 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  34.41 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  34.41 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  34.41 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.41 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.69 
 
 		 583 aa  379  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.88 
 
 		 583 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.24 
 
 		 583 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  38.07 
 
 		 569 aa  379  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  35.82 
 
 		 583 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.25 
 
 		 593 aa  377  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.52 
 
 		 583 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  39.63 
 
 		 579 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 650 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  38.12 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  36.73 
 
 		 589 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  38.59 
 
 		 583 aa  372  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.27 
 
 		 583 aa  372  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  35.04 
 
 		 607 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  35.49 
 
 		 572 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  33.06 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  37.27 
 
 		 583 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.49 
 
 		 610 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  34.35 
 
 		 641 aa  368  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  35.89 
 
 		 581 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  36.2 
 
 		 618 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  35.79 
 
 		 573 aa  365  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  36.85 
 
 		 580 aa  362  9e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  37.73 
 
 		 590 aa  359  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  40.42 
 
 		 581 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  36.85 
 
 		 607 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  36.74 
 
 		 571 aa  355  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.52 
 
 		 586 aa  355  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  34.52 
 
 		 586 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  33.5 
 
 		 598 aa  353  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.35 
 
 		 586 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.06 
 
 		 581 aa  353  7e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.12 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  33.16 
 
 		 577 aa  352  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  34.51 
 
 		 586 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  34.18 
 
 		 586 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.18 
 
 		 586 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.31 
 
 		 586 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.87 
 
 		 581 aa  350  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  35.44 
 
 		 584 aa  349  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  37.85 
 
 		 601 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.81 
 
 		 548 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.27 
 
 		 591 aa  347  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  35.91 
 
 		 586 aa  347  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.16 
 
 		 590 aa  346  7e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.16 
 
 		 590 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  35.54 
 
 		 581 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  33.16 
 
 		 590 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  32.82 
 
 		 577 aa  345  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  36.18 
 
 		 595 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.84 
 
 		 588 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  34.01 
 
 		 574 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  36.81 
 
 		 573 aa  345  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  34.08 
 
 		 574 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.89 
 
 		 588 aa  343  4e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.52 
 
 		 556 aa  343  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.99 
 
 		 590 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.72 
 
 		 588 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.86 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.72 
 
 		 588 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.83 
 
 		 590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.83 
 
 		 590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.83 
 
 		 590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.772204 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  32.83 
 
 		 590 aa  340  4e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.33 
 
 		 589 aa  340  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  36.68 
 
 		 587 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0818  ABC transporter related  37.15 
 
 		 569 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153053  normal  0.572134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  33.05 
 
 		 579 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  34.54 
 
 		 584 aa  336  7.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.89 
 
 		 588 aa  336  9e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>