More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1066 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  60.63 
 
 		 573 aa  714    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  100 
 
 		 571 aa  1162    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  49.65 
 
 		 577 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  49.47 
 
 		 577 aa  585  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  48.33 
 
 		 573 aa  572  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  40.88 
 
 		 582 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  38.54 
 
 		 589 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  35.28 
 
 		 589 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.46 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.93 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  34.8 
 
 		 611 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  34.79 
 
 		 583 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  33.93 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.93 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.93 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  34.45 
 
 		 584 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.93 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.93 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.46 
 
 		 583 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  37.41 
 
 		 541 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  33.93 
 
 		 583 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.46 
 
 		 583 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 		 586 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.45 
 
 		 586 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.27 
 
 		 586 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.45 
 
 		 586 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 		 586 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  34.81 
 
 		 618 aa  379  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 		 586 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  33.75 
 
 		 586 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  33.27 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 579 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  34.44 
 
 		 579 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  34.34 
 
 		 598 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.63 
 
 		 610 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.93 
 
 		 581 aa  361  2e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.36 
 
 		 548 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.27 
 
 		 555 aa  359  6e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  34.88 
 
 		 598 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  35.79 
 
 		 569 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0833  ABC transporter related  33.33 
 
 		 612 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0369945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  36.03 
 
 		 583 aa  354  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.21 
 
 		 590 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.21 
 
 		 590 aa  353  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  33.21 
 
 		 590 aa  353  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.51 
 
 		 593 aa  353  7e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 		 590 aa  352  8e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 		 590 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  34.03 
 
 		 591 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 		 590 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 		 590 aa  352  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  36.59 
 
 		 588 aa  350  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  34.14 
 
 		 595 aa  350  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  34.03 
 
 		 580 aa  349  6e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0563  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 		 590 aa  349  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0503  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 		 590 aa  349  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0509  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 		 590 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.726436 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0500  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 		 590 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0519  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 		 590 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  32.68 
 
 		 590 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  32.75 
 
 		 579 aa  348  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  34.74 
 
 		 578 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  31.92 
 
 		 607 aa  346  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  32.4 
 
 		 579 aa  346  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.68 
 
 		 588 aa  343  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  30.51 
 
 		 583 aa  342  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.57 
 
 		 588 aa  340  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.68 
 
 		 589 aa  339  8e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  30.74 
 
 		 590 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  32.98 
 
 		 623 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  33.85 
 
 		 585 aa  334  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.98 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.8 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.8 
 
 		 590 aa  331  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  33.05 
 
 		 592 aa  331  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.8 
 
 		 588 aa  330  4e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  34.88 
 
 		 604 aa  329  7e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.92 
 
 		 591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  29.79 
 
 		 584 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0371  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.08 
 
 		 553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  32.57 
 
 		 586 aa  325  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  33.39 
 
 		 593 aa  324  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  30.44 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  32.15 
 
 		 596 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  30.09 
 
 		 574 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  31.91 
 
 		 586 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  30.09 
 
 		 574 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  34.51 
 
 		 600 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  32.93 
 
 		 593 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  33.45 
 
 		 603 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.92 
 
 		 588 aa  316  8e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  32.43 
 
 		 606 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  32.73 
 
 		 641 aa  315  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  32.81 
 
 		 572 aa  313  4.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  34.16 
 
 		 607 aa  313  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  29.57 
 
 		 627 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  33.16 
 
 		 588 aa  312  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  32.35 
 
 		 650 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>