More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4402 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  65.61 
 
 
574 aa  766    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  63.53 
 
 
607 aa  772    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  63.93 
 
 
583 aa  773    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  67.13 
 
 
590 aa  795    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  61.1 
 
 
588 aa  686    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  65.79 
 
 
574 aa  768    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  100 
 
 
584 aa  1177    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  67.07 
 
 
581 aa  775    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  49.23 
 
 
600 aa  578  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  48.28 
 
 
598 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  48.62 
 
 
583 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  50.09 
 
 
581 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09061  multidrug ABC transporter  49.74 
 
 
581 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06901  multidrug ABC transporter  47.76 
 
 
583 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.780793  normal  0.494245 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  48.7 
 
 
583 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  48.35 
 
 
583 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  48.51 
 
 
581 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09041  multidrug ABC transporter  50.09 
 
 
581 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  39.58 
 
 
541 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  36.44 
 
 
611 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.46 
 
 
610 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  37.15 
 
 
582 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  36.68 
 
 
569 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  38.47 
 
 
650 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  36.18 
 
 
591 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  36.19 
 
 
618 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  33.15 
 
 
579 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  37.04 
 
 
569 aa  359  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  35.51 
 
 
592 aa  357  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  35.45 
 
 
598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  34.43 
 
 
589 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  34.73 
 
 
588 aa  351  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  32.87 
 
 
573 aa  349  7e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  33.74 
 
 
585 aa  348  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  34.55 
 
 
586 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  32.35 
 
 
577 aa  348  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.36 
 
 
590 aa  348  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  37.35 
 
 
600 aa  347  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.36 
 
 
590 aa  346  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  34.36 
 
 
590 aa  346  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  34.08 
 
 
583 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  34.08 
 
 
583 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.08 
 
 
583 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.08 
 
 
583 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.08 
 
 
583 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.19 
 
 
590 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.19 
 
 
590 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.19 
 
 
590 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.08 
 
 
583 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.91 
 
 
583 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  34.02 
 
 
590 aa  342  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  34.08 
 
 
583 aa  342  8e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  34.54 
 
 
598 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  33.5 
 
 
596 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  39.38 
 
 
604 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  34.6 
 
 
580 aa  341  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.9 
 
 
590 aa  340  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.76 
 
 
591 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  34.57 
 
 
589 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.26 
 
 
583 aa  336  7e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  32.35 
 
 
577 aa  335  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  33.04 
 
 
595 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  33.39 
 
 
579 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.08 
 
 
583 aa  333  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  33.04 
 
 
587 aa  332  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  32.7 
 
 
583 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  32.46 
 
 
586 aa  332  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.57 
 
 
593 aa  330  3e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  32.19 
 
 
604 aa  330  6e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.93 
 
 
590 aa  329  7e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  33.5 
 
 
593 aa  329  9e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  32.87 
 
 
583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0563  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.65 
 
 
590 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0500  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.47 
 
 
590 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0519  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.47 
 
 
590 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0509  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.47 
 
 
590 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.726436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0503  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.47 
 
 
590 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  32.72 
 
 
594 aa  324  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.92 
 
 
586 aa  323  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  33.09 
 
 
585 aa  323  7e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  32.41 
 
 
578 aa  322  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.61 
 
 
588 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.57 
 
 
586 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.45 
 
 
588 aa  319  7e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.57 
 
 
586 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.81 
 
 
586 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.95 
 
 
589 aa  318  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  32.4 
 
 
586 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  33.22 
 
 
581 aa  318  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  29.63 
 
 
571 aa  318  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  32.4 
 
 
586 aa  317  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.4 
 
 
586 aa  317  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.07 
 
 
555 aa  317  5e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  32.4 
 
 
586 aa  316  6e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0371  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.26 
 
 
553 aa  316  6e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  32.4 
 
 
586 aa  316  9e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.84 
 
 
588 aa  316  9e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  32.14 
 
 
606 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  34.61 
 
 
588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  32.49 
 
 
593 aa  313  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>