More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6331 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  71.45 
 
 		 593 aa  907    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  100 
 
 		 593 aa  1204    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  51.44 
 
 		 594 aa  643    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  54.05 
 
 		 596 aa  675    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  52.11 
 
 		 598 aa  630  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  48.8 
 
 		 606 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  50.67 
 
 		 592 aa  602  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  49.24 
 
 		 585 aa  598  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  44.39 
 
 		 600 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  45.07 
 
 		 581 aa  507  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  41.07 
 
 		 586 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  41.11 
 
 		 583 aa  473  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  42.1 
 
 		 591 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  40.5 
 
 		 587 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  40.83 
 
 		 586 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  40.9 
 
 		 604 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  42.28 
 
 		 583 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  40.3 
 
 		 582 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  41.68 
 
 		 588 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  39.27 
 
 		 585 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  38.57 
 
 		 589 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 578 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  36.85 
 
 		 572 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  36.01 
 
 		 611 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  38.54 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  35.03 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 579 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  38 
 
 		 583 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.17 
 
 		 583 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.67 
 
 		 583 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  36.4 
 
 		 569 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  35.01 
 
 		 583 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  35.4 
 
 		 579 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  35.28 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  35.28 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  35.28 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.28 
 
 		 583 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.28 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.77 
 
 		 583 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.28 
 
 		 583 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.32 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  35 
 
 		 641 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  36.38 
 
 		 583 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.02 
 
 		 593 aa  365  1e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  34.5 
 
 		 618 aa  364  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  35.53 
 
 		 603 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  37.79 
 
 		 588 aa  355  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  38.03 
 
 		 607 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  36.02 
 
 		 569 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  33.96 
 
 		 581 aa  352  8e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  34.3 
 
 		 590 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 650 aa  349  9e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  34.73 
 
 		 581 aa  349  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  35.03 
 
 		 581 aa  349  9e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.56 
 
 		 590 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.39 
 
 		 590 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  38.9 
 
 		 578 aa  348  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.56 
 
 		 590 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  33.39 
 
 		 590 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35 
 
 		 556 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.78 
 
 		 586 aa  347  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.61 
 
 		 586 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  35.1 
 
 		 573 aa  345  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  33.39 
 
 		 607 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.39 
 
 		 590 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.39 
 
 		 590 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.39 
 
 		 590 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.26 
 
 		 573 aa  343  5e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  36.46 
 
 		 595 aa  343  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 590 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.44 
 
 		 586 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  37.79 
 
 		 641 aa  343  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.28 
 
 		 586 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.82 
 
 		 586 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  38.31 
 
 		 642 aa  342  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.08 
 
 		 610 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  34.98 
 
 		 584 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  33.11 
 
 		 586 aa  339  8e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.11 
 
 		 586 aa  339  8e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  32.83 
 
 		 583 aa  339  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  35.02 
 
 		 575 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.28 
 
 		 586 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.78 
 
 		 581 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  34.56 
 
 		 577 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  38.22 
 
 		 588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  34.55 
 
 		 573 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  34.86 
 
 		 580 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  38.05 
 
 		 601 aa  336  7e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.83 
 
 		 606 aa  336  7.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 581 aa  336  7.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  35.44 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.17 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  34.33 
 
 		 580 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  33.05 
 
 		 602 aa  335  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  35.58 
 
 		 582 aa  335  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  36.21 
 
 		 550 aa  334  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  31.86 
 
 		 598 aa  334  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 575 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  34.55 
 
 		 577 aa  333  5e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.77 
 
 		 586 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>