More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2448 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  100 
 
 
594 aa  1210    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  51.44 
 
 
593 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  50.17 
 
 
593 aa  616  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  48.63 
 
 
606 aa  580  1e-164  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  48.4 
 
 
585 aa  579  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  49.83 
 
 
596 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  48.47 
 
 
592 aa  556  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  45.39 
 
 
598 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  43.84 
 
 
581 aa  505  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  39.77 
 
 
600 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  41.67 
 
 
587 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  42.11 
 
 
583 aa  455  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  41.07 
 
 
586 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  39.87 
 
 
586 aa  458  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  39.4 
 
 
591 aa  438  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  39.26 
 
 
604 aa  432  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  41.29 
 
 
583 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 
585 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
588 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  37.26 
 
 
589 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  33.89 
 
 
579 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  35.97 
 
 
578 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  35.37 
 
 
572 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  36.43 
 
 
611 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  39.26 
 
 
582 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  36.23 
 
 
589 aa  363  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
579 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  35.22 
 
 
641 aa  358  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.12 
 
 
583 aa  356  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.92 
 
 
583 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  35.18 
 
 
583 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.45 
 
 
583 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  35.53 
 
 
583 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  35.53 
 
 
583 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  35.53 
 
 
583 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  36.79 
 
 
583 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.53 
 
 
583 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.53 
 
 
583 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.06 
 
 
583 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  36.67 
 
 
573 aa  351  3e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  35.37 
 
 
581 aa  350  5e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  35.62 
 
 
583 aa  349  9e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.45 
 
 
555 aa  346  6e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  35.99 
 
 
541 aa  346  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  32.26 
 
 
590 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  35.21 
 
 
573 aa  344  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  34.19 
 
 
569 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  33.11 
 
 
602 aa  339  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  34.25 
 
 
603 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  39.39 
 
 
578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.16 
 
 
610 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  34.1 
 
 
607 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  34.76 
 
 
618 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  32.48 
 
 
583 aa  334  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  33.64 
 
 
650 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.54 
 
 
581 aa  334  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  35.28 
 
 
607 aa  333  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.42 
 
 
593 aa  331  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  36.21 
 
 
588 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  35.6 
 
 
581 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  33.78 
 
 
601 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  33.78 
 
 
601 aa  329  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.56 
 
 
586 aa  329  8e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.12 
 
 
590 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  35.12 
 
 
590 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  34.9 
 
 
581 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.66 
 
 
588 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.97 
 
 
556 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.67 
 
 
590 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.99 
 
 
606 aa  327  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.55 
 
 
573 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.23 
 
 
586 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  32.66 
 
 
574 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  36.75 
 
 
641 aa  326  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.66 
 
 
589 aa  326  8.000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.32 
 
 
601 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  32.87 
 
 
595 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  33.04 
 
 
590 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 
590 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  33.95 
 
 
588 aa  325  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 
590 aa  324  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  34.89 
 
 
589 aa  325  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 
590 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  34.19 
 
 
569 aa  324  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.23 
 
 
586 aa  324  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  33.98 
 
 
577 aa  324  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  32.49 
 
 
574 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.69 
 
 
590 aa  323  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  33.28 
 
 
581 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  35.66 
 
 
580 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  36.11 
 
 
588 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.16 
 
 
575 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  36.23 
 
 
580 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.03 
 
 
586 aa  321  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.03 
 
 
586 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  35.67 
 
 
575 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  34.07 
 
 
577 aa  320  6e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  32.54 
 
 
601 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  34.83 
 
 
586 aa  319  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.45 
 
 
578 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>