More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1251 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  87.06 
 
 		 603 aa  976    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 607 aa  1213    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  58.32 
 
 		 583 aa  654    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  42.36 
 
 		 591 aa  482  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  39.87 
 
 		 611 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  36.44 
 
 		 582 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  37.23 
 
 		 569 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.6 
 
 		 610 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  39.23 
 
 		 600 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  38.82 
 
 		 572 aa  402  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  36.76 
 
 		 589 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  36.86 
 
 		 583 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  40.44 
 
 		 541 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  36.58 
 
 		 569 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  38.39 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  36.38 
 
 		 587 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  38.47 
 
 		 598 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  36.36 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  35.43 
 
 		 593 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  35.86 
 
 		 586 aa  389  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  37.09 
 
 		 586 aa  389  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3127  ABC transporter related  41.1 
 
 		 584 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  34.96 
 
 		 598 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  36.12 
 
 		 604 aa  385  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  36.59 
 
 		 641 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  36.89 
 
 		 585 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  33.99 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  35 
 
 		 593 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  33.6 
 
 		 585 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  34.62 
 
 		 581 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  35.5 
 
 		 589 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  36.98 
 
 		 596 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.28 
 
 		 581 aa  365  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  37.17 
 
 		 579 aa  365  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  37.13 
 
 		 579 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0283  ABC transporter related protein  38.93 
 
 		 604 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  33.72 
 
 		 586 aa  361  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.43 
 
 		 581 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.84 
 
 		 583 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  34.11 
 
 		 573 aa  357  2.9999999999999997e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  39.92 
 
 		 580 aa  355  8.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.51 
 
 		 583 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  32.89 
 
 		 573 aa  354  2e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  33 
 
 		 583 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  31.18 
 
 		 592 aa  353  5e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  32.68 
 
 		 583 aa  353  7e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  32.68 
 
 		 583 aa  353  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.68 
 
 		 583 aa  353  7e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  39.42 
 
 		 642 aa  352  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.61 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.51 
 
 		 583 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  33.22 
 
 		 584 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  32.73 
 
 		 583 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  33.01 
 
 		 606 aa  350  4e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.28 
 
 		 586 aa  349  8e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  38.41 
 
 		 641 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.28 
 
 		 586 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.39 
 
 		 593 aa  348  1e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  33.66 
 
 		 581 aa  348  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.11 
 
 		 586 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  33.94 
 
 		 594 aa  347  5e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  32.94 
 
 		 586 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.94 
 
 		 586 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  32.35 
 
 		 618 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 		 586 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.94 
 
 		 586 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.45 
 
 		 601 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  31.51 
 
 		 580 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33 
 
 		 583 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  33.22 
 
 		 588 aa  341  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.9 
 
 		 555 aa  339  8e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.04 
 
 		 581 aa  339  9e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  38.1 
 
 		 589 aa  339  9e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.68 
 
 		 583 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  32.55 
 
 		 583 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.7 
 
 		 588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.91 
 
 		 606 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  32.89 
 
 		 583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  35.6 
 
 		 588 aa  336  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  35.26 
 
 		 650 aa  334  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  32.89 
 
 		 577 aa  334  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.68 
 
 		 548 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  32.18 
 
 		 578 aa  330  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  33.62 
 
 		 571 aa  330  4e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  33.93 
 
 		 595 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.15 
 
 		 573 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  35.47 
 
 		 588 aa  330  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  34.05 
 
 		 782 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.95 
 
 		 586 aa  329  1.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.11 
 
 		 594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  32.72 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  33.11 
 
 		 577 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 604 aa  325  1e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  33.56 
 
 		 600 aa  324  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  34.49 
 
 		 588 aa  325  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  32.88 
 
 		 581 aa  325  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  31.4 
 
 		 583 aa  325  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.7 
 
 		 556 aa  324  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.92 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>