More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1938 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.51 
 
 
586 aa  681    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
593 aa  1212    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  47.21 
 
 
583 aa  580  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  46.34 
 
 
583 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.4 
 
 
588 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  46.9 
 
 
589 aa  569  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  45.64 
 
 
583 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  45.64 
 
 
583 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.64 
 
 
583 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.82 
 
 
583 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.64 
 
 
583 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  45.47 
 
 
583 aa  561  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.64 
 
 
583 aa  561  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.82 
 
 
583 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.17 
 
 
583 aa  558  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  47.39 
 
 
579 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  44.09 
 
 
595 aa  515  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.21 
 
 
581 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.71 
 
 
555 aa  498  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  40.48 
 
 
591 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  41.11 
 
 
584 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.14 
 
 
586 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  41.14 
 
 
586 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.96 
 
 
586 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  39.25 
 
 
588 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  40.94 
 
 
586 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  40.79 
 
 
586 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  40.79 
 
 
586 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  40.52 
 
 
582 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  39.02 
 
 
590 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.79 
 
 
586 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.72 
 
 
586 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  39.15 
 
 
589 aa  462  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  39.45 
 
 
590 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  40.66 
 
 
590 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39.28 
 
 
590 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.62 
 
 
586 aa  458  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  38.98 
 
 
590 aa  458  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  38.98 
 
 
590 aa  458  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  38.98 
 
 
590 aa  458  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  39.28 
 
 
590 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  38.81 
 
 
590 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0833  ABC transporter related  42.33 
 
 
612 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0369945  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0563  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  38.78 
 
 
590 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0503  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  38.61 
 
 
590 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  38.45 
 
 
579 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0509  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  38.61 
 
 
590 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.726436 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  40.42 
 
 
588 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  39.02 
 
 
579 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0519  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  38.61 
 
 
590 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  40.24 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0500  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  38.44 
 
 
590 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  40.24 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  38.32 
 
 
588 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.36 
 
 
548 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  37.52 
 
 
618 aa  433  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  38.62 
 
 
573 aa  421  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0371  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  38.67 
 
 
553 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2867  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  37.94 
 
 
607 aa  411  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  37.79 
 
 
589 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  39.16 
 
 
580 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  35.25 
 
 
598 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  35.67 
 
 
600 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  34.66 
 
 
623 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  37.78 
 
 
588 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  35.48 
 
 
593 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  33.93 
 
 
573 aa  365  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  34.62 
 
 
577 aa  365  1e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  34.44 
 
 
586 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  34.21 
 
 
611 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  35.68 
 
 
598 aa  360  5e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  34.38 
 
 
585 aa  359  9e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  34.3 
 
 
592 aa  357  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  37.76 
 
 
541 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  34.15 
 
 
577 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  33.45 
 
 
583 aa  351  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  35.02 
 
 
593 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  35.6 
 
 
571 aa  344  2.9999999999999997e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
578 aa  342  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  32.58 
 
 
586 aa  340  4e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  32.24 
 
 
606 aa  340  5.9999999999999996e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  35.33 
 
 
591 aa  339  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  35.14 
 
 
581 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  34.9 
 
 
572 aa  336  7.999999999999999e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2810  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
584 aa  336  7.999999999999999e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000027505  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  35.96 
 
 
583 aa  334  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  35.42 
 
 
594 aa  331  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.03 
 
 
610 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  34.31 
 
 
569 aa  329  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  33.39 
 
 
581 aa  329  9e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  34.35 
 
 
596 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  34.43 
 
 
583 aa  328  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  33.68 
 
 
590 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  33.97 
 
 
607 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  32.04 
 
 
579 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  33.57 
 
 
584 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  34.54 
 
 
581 aa  324  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  32.06 
 
 
604 aa  319  7.999999999999999e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  33.68 
 
 
583 aa  318  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  31.46 
 
 
587 aa  319  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>