More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0802 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  76.01 
 
 
578 aa  884    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  100 
 
 
572 aa  1149    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  43.67 
 
 
641 aa  477  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  41.3 
 
 
588 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  40.1 
 
 
591 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  41.55 
 
 
583 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  39.56 
 
 
600 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  38.38 
 
 
583 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  38.33 
 
 
586 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  39.41 
 
 
587 aa  398  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  38.51 
 
 
586 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
569 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  37.69 
 
 
596 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  36.81 
 
 
593 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  36.85 
 
 
593 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  38.05 
 
 
604 aa  382  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  38.86 
 
 
611 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  38.73 
 
 
592 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  40.44 
 
 
541 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  37.1 
 
 
585 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  38.32 
 
 
607 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  38.18 
 
 
603 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  37.93 
 
 
582 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  39.24 
 
 
583 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  38.5 
 
 
585 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  35.49 
 
 
598 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  40.57 
 
 
569 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  35.37 
 
 
594 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.91 
 
 
610 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  35.66 
 
 
581 aa  353  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  38.92 
 
 
650 aa  353  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.69 
 
 
581 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  35.36 
 
 
579 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  35.22 
 
 
589 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  34.57 
 
 
618 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 
604 aa  345  1e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 
583 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  33.22 
 
 
583 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.56 
 
 
583 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 
583 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  37.64 
 
 
580 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  33.87 
 
 
583 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.87 
 
 
583 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 
583 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 
583 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.93 
 
 
583 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.9 
 
 
593 aa  336  7.999999999999999e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  36.45 
 
 
589 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.8 
 
 
583 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.41 
 
 
583 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  35.43 
 
 
595 aa  332  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  35.89 
 
 
579 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  39.56 
 
 
581 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  34.4 
 
 
607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.24 
 
 
598 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.4 
 
 
555 aa  325  9e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  35.12 
 
 
588 aa  325  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  35.74 
 
 
573 aa  324  3e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  39.2 
 
 
577 aa  324  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  36.13 
 
 
598 aa  323  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.29 
 
 
581 aa  323  7e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  37.2 
 
 
604 aa  322  9.000000000000001e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  35.43 
 
 
588 aa  320  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  33.79 
 
 
606 aa  320  6e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  34.31 
 
 
577 aa  319  7e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  33.87 
 
 
583 aa  316  9e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  33.28 
 
 
577 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  37.32 
 
 
589 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  32.93 
 
 
580 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.73 
 
 
582 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  33.56 
 
 
573 aa  313  6.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  33.64 
 
 
571 aa  310  4e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  35.63 
 
 
615 aa  309  6.999999999999999e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  34.48 
 
 
579 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  34.79 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31.98 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1304  ABC transporter related  31.66 
 
 
602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.27 
 
 
586 aa  307  4.0000000000000004e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.13 
 
 
601 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.59 
 
 
578 aa  306  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.59 
 
 
578 aa  306  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  33.45 
 
 
574 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  33.45 
 
 
574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0818  ABC transporter related  37.27 
 
 
569 aa  304  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153053  normal  0.572134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.28 
 
 
636 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.9 
 
 
590 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  33.1 
 
 
578 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.27 
 
 
588 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  30.66 
 
 
584 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.22 
 
 
588 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.22 
 
 
591 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.47 
 
 
606 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.71 
 
 
590 aa  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 
588 aa  303  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.71 
 
 
590 aa  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.71 
 
 
590 aa  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.04 
 
 
588 aa  302  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.71 
 
 
590 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.7 
 
 
590 aa  302  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>