More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0442 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  100 
 
 		 618 aa  1262    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  47.88 
 
 		 582 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  40.29 
 
 		 583 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  40.29 
 
 		 583 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.29 
 
 		 583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  40.29 
 
 		 583 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  40.29 
 
 		 583 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.29 
 
 		 583 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.29 
 
 		 583 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.29 
 
 		 583 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  40.13 
 
 		 583 aa  465  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  40.88 
 
 		 589 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.46 
 
 		 583 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.13 
 
 		 583 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.52 
 
 		 593 aa  441  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  37.93 
 
 		 577 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  39.54 
 
 		 579 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  38.09 
 
 		 573 aa  428  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  39.45 
 
 		 589 aa  425  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  37.08 
 
 		 585 aa  421  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  38.39 
 
 		 595 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  37.6 
 
 		 577 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.6 
 
 		 588 aa  412  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  38.77 
 
 		 579 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  37.44 
 
 		 573 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  36.91 
 
 		 596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  35.17 
 
 		 600 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  38.21 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  37.03 
 
 		 592 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 588 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  35.77 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.74 
 
 		 555 aa  395  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.13 
 
 		 588 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  34.69 
 
 		 611 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.28 
 
 		 588 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.15 
 
 		 591 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  34.21 
 
 		 579 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.95 
 
 		 581 aa  389  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  36.02 
 
 		 593 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  35.3 
 
 		 606 aa  382  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.82 
 
 		 588 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  35.29 
 
 		 604 aa  383  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.48 
 
 		 589 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.61 
 
 		 590 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  36.92 
 
 		 591 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  37.03 
 
 		 641 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.67 
 
 		 586 aa  382  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  35.07 
 
 		 598 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2867  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.22 
 
 		 607 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.61 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.61 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.44 
 
 		 590 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  33.61 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.82 
 
 		 588 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.61 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.82 
 
 		 588 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  35.74 
 
 		 584 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  34.8 
 
 		 586 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  36.2 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.61 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.772204 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  33.44 
 
 		 590 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  35.86 
 
 		 586 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.35 
 
 		 586 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  34.62 
 
 		 580 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.67 
 
 		 586 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  35.7 
 
 		 586 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.7 
 
 		 586 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  36.07 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 578 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.7 
 
 		 586 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  34.8 
 
 		 586 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.03 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.86 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  35.33 
 
 		 583 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  36.44 
 
 		 581 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  35.69 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 593 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  35.62 
 
 		 583 aa  372  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  34.6 
 
 		 571 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  34.57 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  36.19 
 
 		 584 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.73 
 
 		 590 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.02 
 
 		 610 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  35.67 
 
 		 590 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  34.81 
 
 		 650 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.47 
 
 		 548 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  34.65 
 
 		 585 aa  360  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0519  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.84 
 
 		 590 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  37.34 
 
 		 583 aa  359  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0563  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.84 
 
 		 590 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0503  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.84 
 
 		 590 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  34.62 
 
 		 572 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0509  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.84 
 
 		 590 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.726436 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0500  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.68 
 
 		 590 aa  356  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  35.91 
 
 		 623 aa  356  8.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  34.6 
 
 		 541 aa  353  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  34.48 
 
 		 574 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  34.48 
 
 		 574 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  34.76 
 
 		 594 aa  349  7e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  33.55 
 
 		 603 aa  348  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>