More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3041 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  76.29 
 
 
590 aa  911    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0371  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.41 
 
 
553 aa  848    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  76.07 
 
 
590 aa  911    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2867  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  73.25 
 
 
607 aa  851    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0503  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.08 
 
 
590 aa  886    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  51.99 
 
 
579 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  100 
 
 
588 aa  1199    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  76.29 
 
 
590 aa  911    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0509  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.08 
 
 
590 aa  888    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.726436 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  76.07 
 
 
590 aa  912    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  76.12 
 
 
590 aa  909    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  76.07 
 
 
590 aa  912    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0563  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.25 
 
 
590 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  99.66 
 
 
588 aa  1194    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  74.15 
 
 
588 aa  879    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  76.98 
 
 
589 aa  903    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  82.39 
 
 
591 aa  967    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0519  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.21 
 
 
590 aa  887    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  99.49 
 
 
588 aa  1193    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  76.07 
 
 
590 aa  912    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  76.63 
 
 
588 aa  907    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  76.07 
 
 
590 aa  913    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  77.41 
 
 
590 aa  900    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  51.99 
 
 
579 aa  641    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0500  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.21 
 
 
590 aa  885    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  48.2 
 
 
589 aa  569  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  46.47 
 
 
583 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.61 
 
 
583 aa  552  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.61 
 
 
583 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  45.78 
 
 
583 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  45.78 
 
 
583 aa  549  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  45.27 
 
 
583 aa  549  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.78 
 
 
583 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  45.78 
 
 
583 aa  547  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
579 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.61 
 
 
583 aa  548  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.78 
 
 
583 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  45.95 
 
 
595 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.61 
 
 
583 aa  538  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.7 
 
 
581 aa  483  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  41.91 
 
 
586 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.91 
 
 
586 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.91 
 
 
586 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  41.91 
 
 
586 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  41.22 
 
 
586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.91 
 
 
586 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.91 
 
 
586 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.9 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  41.55 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.44 
 
 
588 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.47 
 
 
555 aa  464  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  40.81 
 
 
584 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.42 
 
 
593 aa  457  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  38 
 
 
582 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.62 
 
 
548 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0833  ABC transporter related  40.27 
 
 
612 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0369945  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.5 
 
 
586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  38.83 
 
 
598 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  36.1 
 
 
589 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  34.63 
 
 
577 aa  391  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  33.82 
 
 
618 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  33.95 
 
 
592 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  34.63 
 
 
577 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  34.13 
 
 
585 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  34.51 
 
 
573 aa  359  8e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  32.63 
 
 
573 aa  353  4e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  36.3 
 
 
591 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  32.89 
 
 
598 aa  346  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.94 
 
 
581 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  34.85 
 
 
579 aa  339  8e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  33.99 
 
 
588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  35.93 
 
 
600 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  35.17 
 
 
580 aa  335  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  33.05 
 
 
593 aa  332  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  32.88 
 
 
606 aa  332  1e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  33.86 
 
 
578 aa  331  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  32.59 
 
 
583 aa  330  5.0000000000000004e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  32.8 
 
 
571 aa  328  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  33.68 
 
 
611 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  32.47 
 
 
607 aa  324  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  31.57 
 
 
596 aa  323  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  34.57 
 
 
569 aa  323  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.45 
 
 
575 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  35.73 
 
 
541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  31.43 
 
 
584 aa  320  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  33.51 
 
 
581 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  32.58 
 
 
581 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  35.93 
 
 
764 aa  317  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  31.51 
 
 
586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  30.69 
 
 
583 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  33.39 
 
 
641 aa  313  6.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 
590 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  36.1 
 
 
750 aa  310  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  32.98 
 
 
604 aa  310  6.999999999999999e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  36.1 
 
 
770 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  35.99 
 
 
773 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  32.89 
 
 
593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  31.83 
 
 
581 aa  307  4.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  31.87 
 
 
574 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  35.19 
 
 
760 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>