More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003564 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  52.5 
 
 
590 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  52.16 
 
 
590 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  52.68 
 
 
588 aa  636    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  53.2 
 
 
588 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  52.5 
 
 
590 aa  653    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  52.16 
 
 
590 aa  651    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  52.5 
 
 
590 aa  654    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  88.26 
 
 
579 aa  1072    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  52.5 
 
 
590 aa  654    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  52.5 
 
 
590 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  52.5 
 
 
590 aa  654    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  52.16 
 
 
591 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  100 
 
 
579 aa  1182    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  53.02 
 
 
589 aa  640    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  52.33 
 
 
588 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  51.99 
 
 
588 aa  626  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  51.99 
 
 
588 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2867  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  52.68 
 
 
607 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  51.64 
 
 
590 aa  622  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0500  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  51.12 
 
 
590 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0563  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  51.3 
 
 
590 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0509  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  51.3 
 
 
590 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.726436 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0519  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  51.3 
 
 
590 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0503  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  51.3 
 
 
590 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0371  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  52.17 
 
 
553 aa  609  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  45.52 
 
 
583 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  45.52 
 
 
589 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  43.97 
 
 
583 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  43.97 
 
 
583 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.79 
 
 
583 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.97 
 
 
583 aa  534  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.97 
 
 
583 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.14 
 
 
583 aa  534  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  43.89 
 
 
583 aa  529  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  44.17 
 
 
583 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.97 
 
 
583 aa  525  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.62 
 
 
583 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  46.29 
 
 
579 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  46.02 
 
 
595 aa  515  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.41 
 
 
581 aa  499  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.9 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  39.79 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.14 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  39.79 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.48 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.79 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.97 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  39.44 
 
 
586 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  39.62 
 
 
586 aa  465  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.11 
 
 
555 aa  462  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  38.57 
 
 
584 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.45 
 
 
593 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.41 
 
 
548 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.1 
 
 
588 aa  434  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  39.4 
 
 
582 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.17 
 
 
586 aa  421  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0833  ABC transporter related  38.39 
 
 
612 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0369945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  38.84 
 
 
589 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  38.77 
 
 
618 aa  395  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  33.45 
 
 
577 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  33.27 
 
 
577 aa  357  5e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  32.87 
 
 
573 aa  348  1e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  34.56 
 
 
600 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  34.21 
 
 
579 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  33.05 
 
 
598 aa  336  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  35.07 
 
 
580 aa  336  5.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  32.64 
 
 
573 aa  336  7e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  32.4 
 
 
571 aa  333  4e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  36.18 
 
 
591 aa  333  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  35.97 
 
 
541 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  34.09 
 
 
598 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  33.28 
 
 
583 aa  332  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  35.32 
 
 
588 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  35.32 
 
 
592 aa  329  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  33.39 
 
 
593 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  31.68 
 
 
585 aa  325  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  32.53 
 
 
586 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  33.86 
 
 
569 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  35.04 
 
 
581 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  33.16 
 
 
611 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  33.28 
 
 
593 aa  314  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  33.69 
 
 
587 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  33.73 
 
 
606 aa  310  4e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  31.96 
 
 
583 aa  310  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  34.48 
 
 
572 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  32.06 
 
 
578 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  33.79 
 
 
623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  33.45 
 
 
604 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  31.06 
 
 
586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  33.91 
 
 
590 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.16 
 
 
575 aa  307  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  34.46 
 
 
569 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0922  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.9 
 
 
597 aa  303  5.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000416921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.86 
 
 
610 aa  302  9e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  32.42 
 
 
596 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  33.13 
 
 
585 aa  300  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31.75 
 
 
581 aa  299  9e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.64 
 
 
578 aa  296  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.64 
 
 
578 aa  296  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2810  ABC transporter related protein  30.72 
 
 
584 aa  294  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000027505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>