More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0839 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1502  ATPase  64.69 
 
 		 587 aa  788    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  63.03 
 
 		 604 aa  783    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  65.81 
 
 		 583 aa  782    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  64.29 
 
 		 586 aa  782    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  64.74 
 
 		 586 aa  799    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  74.19 
 
 		 583 aa  906    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 585 aa  1196    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  42.57 
 
 		 585 aa  488  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  42.72 
 
 		 600 aa  491  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  42.83 
 
 		 591 aa  482  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  41.74 
 
 		 593 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  42.03 
 
 		 596 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  38.69 
 
 		 592 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  41.01 
 
 		 598 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  40.46 
 
 		 594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  39.79 
 
 		 582 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  39.97 
 
 		 593 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  40.52 
 
 		 589 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  41.16 
 
 		 588 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  39.09 
 
 		 606 aa  424  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 578 aa  419  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  37.12 
 
 		 611 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 579 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  36.08 
 
 		 569 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  37.78 
 
 		 581 aa  399  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  39.35 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  37.95 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 650 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  38.08 
 
 		 583 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  36.72 
 
 		 603 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  36.77 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  36.08 
 
 		 569 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  34.78 
 
 		 618 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.05 
 
 		 610 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  36.11 
 
 		 607 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.95 
 
 		 556 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  34.92 
 
 		 641 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  34.26 
 
 		 589 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  33.97 
 
 		 583 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.2 
 
 		 555 aa  363  6e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  33.16 
 
 		 583 aa  362  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  35.59 
 
 		 575 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  33.8 
 
 		 583 aa  361  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  33.33 
 
 		 598 aa  360  5e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 581 aa  358  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  33.86 
 
 		 598 aa  357  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  32.93 
 
 		 600 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  34.44 
 
 		 584 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  38.14 
 
 		 641 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  34.14 
 
 		 586 aa  353  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  34.65 
 
 		 588 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  38.42 
 
 		 604 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.97 
 
 		 586 aa  352  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.97 
 
 		 586 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  33.68 
 
 		 574 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  33.79 
 
 		 586 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  33.97 
 
 		 586 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.97 
 
 		 586 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.59 
 
 		 583 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  33.63 
 
 		 574 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.79 
 
 		 586 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.88 
 
 		 598 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.79 
 
 		 586 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  38.62 
 
 		 589 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 579 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  33.68 
 
 		 607 aa  348  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.8 
 
 		 581 aa  347  3e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  32.82 
 
 		 583 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.76 
 
 		 583 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.42 
 
 		 583 aa  347  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.62 
 
 		 586 aa  346  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  32.59 
 
 		 583 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  32.59 
 
 		 583 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  32.59 
 
 		 583 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.59 
 
 		 583 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  34.7 
 
 		 581 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  32.94 
 
 		 590 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.53 
 
 		 583 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.36 
 
 		 583 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  31.67 
 
 		 573 aa  340  4e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  30.23 
 
 		 627 aa  340  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.71 
 
 		 588 aa  340  5e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.85 
 
 		 548 aa  339  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06901  multidrug ABC transporter  31.37 
 
 		 583 aa  339  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.780793  normal  0.494245 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  33.28 
 
 		 581 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.53 
 
 		 593 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  31.22 
 
 		 583 aa  337  5e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 575 aa  336  7e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  34.26 
 
 		 578 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  32.76 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.11 
 
 		 589 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.54 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  33.5 
 
 		 579 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  36.99 
 
 		 582 aa  334  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  30.48 
 
 		 577 aa  335  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  30.53 
 
 		 577 aa  333  4e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  33.28 
 
 		 581 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  33.97 
 
 		 580 aa  333  8e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  30.9 
 
 		 583 aa  332  8e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  32.7 
 
 		 601 aa  332  9e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>