More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1150 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  63.53 
 
 
583 aa  749    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06901  multidrug ABC transporter  67.18 
 
 
583 aa  779    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.780793  normal  0.494245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  81.09 
 
 
598 aa  952    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  100 
 
 
600 aa  1208    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  58.62 
 
 
581 aa  703    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09041  multidrug ABC transporter  58.28 
 
 
581 aa  685    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09061  multidrug ABC transporter  58.1 
 
 
581 aa  704    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  59.11 
 
 
581 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  64.04 
 
 
583 aa  754    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  72.87 
 
 
583 aa  809    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  51.13 
 
 
574 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  50.96 
 
 
574 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  50.52 
 
 
607 aa  588  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  52.43 
 
 
588 aa  587  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  51.13 
 
 
581 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  50.43 
 
 
583 aa  583  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  52.73 
 
 
590 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  49.23 
 
 
584 aa  572  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  39.21 
 
 
650 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  36.02 
 
 
611 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  35.94 
 
 
569 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  38.09 
 
 
541 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.37 
 
 
610 aa  360  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  32.99 
 
 
573 aa  355  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  36.28 
 
 
569 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  34.35 
 
 
591 aa  353  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  33.73 
 
 
586 aa  353  7e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  33.04 
 
 
583 aa  347  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  31.24 
 
 
585 aa  346  6e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  32.59 
 
 
586 aa  344  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  33.1 
 
 
585 aa  343  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  31.02 
 
 
589 aa  337  5.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  32.65 
 
 
587 aa  333  5e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  32.59 
 
 
588 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  35.46 
 
 
600 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  32.24 
 
 
583 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  32.05 
 
 
582 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.63 
 
 
555 aa  331  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  34.29 
 
 
598 aa  329  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  32.7 
 
 
604 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  30.58 
 
 
577 aa  323  4e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  32.45 
 
 
627 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  31.2 
 
 
593 aa  317  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  30.76 
 
 
577 aa  317  5e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  28.31 
 
 
592 aa  316  8e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  30.53 
 
 
618 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  34.78 
 
 
583 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  31.54 
 
 
583 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  30.2 
 
 
598 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  33.68 
 
 
603 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.43 
 
 
583 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  30.35 
 
 
596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  30.56 
 
 
586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  31.6 
 
 
579 aa  307  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  33.79 
 
 
607 aa  306  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  31.28 
 
 
589 aa  306  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  35.82 
 
 
604 aa  306  7e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  29.75 
 
 
593 aa  306  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.38 
 
 
583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  29.72 
 
 
584 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0038  ABC-type transport system, ATPase and permease components  34.92 
 
 
576 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  30.74 
 
 
583 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  31.22 
 
 
581 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  31.26 
 
 
583 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  31.26 
 
 
583 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.26 
 
 
583 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.86 
 
 
586 aa  303  9e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  31.26 
 
 
583 aa  302  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.16 
 
 
586 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.09 
 
 
583 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 
586 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  33.16 
 
 
580 aa  300  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  29.81 
 
 
586 aa  299  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  29.64 
 
 
586 aa  299  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 
586 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.36 
 
 
622 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  33.73 
 
 
579 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.25 
 
 
581 aa  298  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  29.64 
 
 
586 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.64 
 
 
586 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  28.45 
 
 
606 aa  296  1e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  36.2 
 
 
588 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  31.59 
 
 
595 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  30.32 
 
 
581 aa  294  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.68 
 
 
583 aa  294  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.68 
 
 
583 aa  294  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.25 
 
 
590 aa  292  9e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.25 
 
 
590 aa  292  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.25 
 
 
590 aa  292  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  31.99 
 
 
581 aa  292  9e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  31.25 
 
 
590 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.83 
 
 
588 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  31.25 
 
 
590 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.25 
 
 
590 aa  292  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  28.93 
 
 
571 aa  292  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  31.08 
 
 
590 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  34.7 
 
 
626 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  32.53 
 
 
623 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  30.2 
 
 
594 aa  290  7e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.25 
 
 
590 aa  290  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>