More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0845 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  61.27 
 
 
583 aa  719    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  59.86 
 
 
598 aa  714    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  58.62 
 
 
600 aa  712    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  100 
 
 
581 aa  1159    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09041  multidrug ABC transporter  90.71 
 
 
581 aa  1014    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06901  multidrug ABC transporter  63.72 
 
 
583 aa  739    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.780793  normal  0.494245 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09061  multidrug ABC transporter  91.22 
 
 
581 aa  1043    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  83.3 
 
 
581 aa  933    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  61.27 
 
 
583 aa  719    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  60.93 
 
 
583 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  50.61 
 
 
574 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  50.44 
 
 
574 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  50.17 
 
 
581 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  49.3 
 
 
583 aa  568  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  48.44 
 
 
590 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  47.56 
 
 
607 aa  547  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  48.87 
 
 
588 aa  544  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  50.09 
 
 
584 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  35.17 
 
 
569 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  35.53 
 
 
650 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  34.62 
 
 
573 aa  348  1e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  33.51 
 
 
611 aa  347  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  34.51 
 
 
589 aa  346  7e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  35.17 
 
 
569 aa  342  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  32.42 
 
 
583 aa  341  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  34.77 
 
 
541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  32.24 
 
 
591 aa  336  5.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.98 
 
 
610 aa  332  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  33.68 
 
 
582 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  33.16 
 
 
586 aa  330  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  33.51 
 
 
588 aa  329  9e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  36.44 
 
 
600 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  32.53 
 
 
583 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  31.16 
 
 
598 aa  321  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  32.62 
 
 
585 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.94 
 
 
583 aa  320  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.22 
 
 
586 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  32.22 
 
 
586 aa  319  9e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.39 
 
 
586 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.22 
 
 
586 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  32.22 
 
 
586 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  31.43 
 
 
593 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.87 
 
 
586 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  31.45 
 
 
583 aa  317  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  31.49 
 
 
583 aa  316  9e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  31.49 
 
 
583 aa  316  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.49 
 
 
583 aa  316  9e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  31.87 
 
 
586 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  31.38 
 
 
586 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  32.1 
 
 
596 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.87 
 
 
586 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  31.58 
 
 
583 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.59 
 
 
583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.31 
 
 
583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  35.1 
 
 
588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  31.97 
 
 
585 aa  314  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  31.83 
 
 
584 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  31.46 
 
 
586 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.01 
 
 
583 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  31.26 
 
 
598 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  32.39 
 
 
579 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.83 
 
 
583 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  31.38 
 
 
587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  32.48 
 
 
589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  29.07 
 
 
594 aa  307  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  32.35 
 
 
618 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  32.6 
 
 
577 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  32.29 
 
 
583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.06 
 
 
555 aa  301  2e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  29.67 
 
 
604 aa  301  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  29.81 
 
 
593 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.69 
 
 
581 aa  299  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  31.3 
 
 
579 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  33.05 
 
 
577 aa  297  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  31.06 
 
 
579 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  34.11 
 
 
604 aa  296  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.72 
 
 
588 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  29.79 
 
 
590 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  29.52 
 
 
606 aa  295  2e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  29.79 
 
 
590 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  31.99 
 
 
580 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.62 
 
 
590 aa  293  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0818  ABC transporter related  33.21 
 
 
569 aa  293  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153053  normal  0.572134 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  31.6 
 
 
571 aa  292  9e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.03 
 
 
548 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  30.07 
 
 
579 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.79 
 
 
590 aa  292  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.79 
 
 
590 aa  292  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  29.97 
 
 
627 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  30.51 
 
 
592 aa  292  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.79 
 
 
590 aa  292  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.62 
 
 
590 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  29.62 
 
 
590 aa  291  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  29.8 
 
 
641 aa  289  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.95 
 
 
593 aa  287  4e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.75 
 
 
589 aa  287  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.53 
 
 
588 aa  286  5.999999999999999e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  30.49 
 
 
603 aa  286  9e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  30.66 
 
 
581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.86 
 
 
588 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>