More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1309 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  64.38 
 
 		 583 aa  763    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  100 
 
 		 598 aa  1194    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  81.09 
 
 		 600 aa  967    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06901  multidrug ABC transporter  68.48 
 
 		 583 aa  800    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.780793  normal  0.494245 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  59.86 
 
 		 581 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09061  multidrug ABC transporter  59.69 
 
 		 581 aa  723    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  60.48 
 
 		 581 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  64.73 
 
 		 583 aa  769    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  74.23 
 
 		 583 aa  835    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09041  multidrug ABC transporter  59.66 
 
 		 581 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  52.52 
 
 		 574 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  52.35 
 
 		 574 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  52.76 
 
 		 581 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  51.47 
 
 		 583 aa  594  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  51.03 
 
 		 607 aa  595  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  51.92 
 
 		 590 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  50.86 
 
 		 588 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  48.28 
 
 		 584 aa  555  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 650 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  36.77 
 
 		 611 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  35.95 
 
 		 569 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  38.3 
 
 		 541 aa  363  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  33.68 
 
 		 583 aa  360  4e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  36.3 
 
 		 569 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  33.1 
 
 		 586 aa  353  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  33.8 
 
 		 585 aa  353  5e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  33.04 
 
 		 587 aa  350  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.5 
 
 		 610 aa  349  9e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  38.66 
 
 		 600 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  33.28 
 
 		 583 aa  347  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  31.89 
 
 		 589 aa  346  7e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  32.7 
 
 		 573 aa  344  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  32.34 
 
 		 582 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  31.72 
 
 		 586 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  33.22 
 
 		 604 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  34.18 
 
 		 591 aa  336  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  29.88 
 
 		 585 aa  332  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  34.25 
 
 		 598 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  32.41 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  30.49 
 
 		 577 aa  320  5e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  35.95 
 
 		 583 aa  319  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  30.87 
 
 		 598 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.59 
 
 		 555 aa  317  3e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  34.52 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  32.89 
 
 		 627 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  31.11 
 
 		 583 aa  312  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  30.12 
 
 		 584 aa  312  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  32.13 
 
 		 589 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  30.49 
 
 		 577 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  29.05 
 
 		 593 aa  310  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  31.41 
 
 		 579 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  28.69 
 
 		 592 aa  310  6.999999999999999e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  31.35 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  31.35 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.47 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.35 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  31.35 
 
 		 583 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.93 
 
 		 583 aa  307  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.17 
 
 		 583 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  37.26 
 
 		 588 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  30.08 
 
 		 593 aa  306  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  29.68 
 
 		 596 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  30.05 
 
 		 586 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  32.88 
 
 		 607 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.62 
 
 		 586 aa  302  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  30 
 
 		 571 aa  302  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  36.54 
 
 		 604 aa  302  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  28.86 
 
 		 606 aa  300  3e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  33.45 
 
 		 580 aa  301  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  28.38 
 
 		 594 aa  300  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  32.25 
 
 		 603 aa  300  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.62 
 
 		 586 aa  300  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.11 
 
 		 583 aa  300  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  31.62 
 
 		 582 aa  299  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  29.62 
 
 		 586 aa  299  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0038  ABC-type transport system, ATPase and permease components  35.54 
 
 		 576 aa  299  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.44 
 
 		 586 aa  298  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  30.5 
 
 		 581 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.62 
 
 		 586 aa  297  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.93 
 
 		 583 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  29.44 
 
 		 586 aa  296  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.44 
 
 		 586 aa  296  7e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  30.23 
 
 		 583 aa  296  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  29.27 
 
 		 586 aa  296  9e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.99 
 
 		 581 aa  295  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  29.83 
 
 		 581 aa  295  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  29.15 
 
 		 618 aa  295  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.21 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  34.26 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  32.21 
 
 		 623 aa  293  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  31.39 
 
 		 589 aa  292  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.39 
 
 		 597 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  32.07 
 
 		 581 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.25 
 
 		 593 aa  291  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.57 
 
 		 575 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  32.57 
 
 		 578 aa  289  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  29.13 
 
 		 573 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.1 
 
 		 590 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2331  ABC-type multidrug/protein/lipid transport system ATP-binding protein  30.62 
 
 		 609 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.670685  normal  0.815694 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.31 
 
 		 590 aa  287  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>