More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2331 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2331  ABC-type multidrug/protein/lipid transport system ATP-binding protein  100 
 
 		 609 aa  1241    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.670685  normal  0.815694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  33.67 
 
 		 607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  33.98 
 
 		 583 aa  302  9e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  33.74 
 
 		 581 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  33.16 
 
 		 584 aa  291  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  31.96 
 
 		 600 aa  286  5.999999999999999e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  32.06 
 
 		 583 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  30.74 
 
 		 585 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  30.68 
 
 		 611 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  30.29 
 
 		 598 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 		 574 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 		 574 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  32.06 
 
 		 590 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  30.7 
 
 		 589 aa  277  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  29.57 
 
 		 586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  29.06 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  29.9 
 
 		 569 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  31.05 
 
 		 604 aa  271  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.44 
 
 		 583 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  31.12 
 
 		 541 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  28.79 
 
 		 582 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  29.08 
 
 		 583 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  29.08 
 
 		 583 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.08 
 
 		 583 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.08 
 
 		 583 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  29.08 
 
 		 583 aa  267  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.1 
 
 		 583 aa  267  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  32.68 
 
 		 588 aa  267  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  29.81 
 
 		 571 aa  266  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  27.98 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  30.48 
 
 		 587 aa  265  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  29.88 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.98 
 
 		 586 aa  265  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.98 
 
 		 586 aa  265  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.98 
 
 		 586 aa  264  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  29.5 
 
 		 579 aa  264  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.98 
 
 		 586 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  28.57 
 
 		 583 aa  263  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  27.81 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  31.48 
 
 		 604 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  27.63 
 
 		 586 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.63 
 
 		 586 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  31.65 
 
 		 588 aa  261  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  29.92 
 
 		 583 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.42 
 
 		 583 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.28 
 
 		 591 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  30.08 
 
 		 583 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  28.52 
 
 		 583 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  28.31 
 
 		 589 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.25 
 
 		 583 aa  258  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.1 
 
 		 590 aa  258  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  29.74 
 
 		 573 aa  256  6e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.76 
 
 		 590 aa  256  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.62 
 
 		 588 aa  256  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  27.59 
 
 		 586 aa  256  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  28.76 
 
 		 590 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  28.76 
 
 		 590 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  27.6 
 
 		 584 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.76 
 
 		 590 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.76 
 
 		 590 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.76 
 
 		 590 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  30.02 
 
 		 577 aa  254  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  30.48 
 
 		 581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  30.52 
 
 		 583 aa  253  7e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09061  multidrug ABC transporter  30.89 
 
 		 581 aa  253  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  28.76 
 
 		 590 aa  253  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.62 
 
 		 589 aa  252  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  27.65 
 
 		 592 aa  251  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.63 
 
 		 548 aa  251  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  27.33 
 
 		 591 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0563  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.96 
 
 		 590 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  28.86 
 
 		 598 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0519  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.96 
 
 		 590 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0509  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.96 
 
 		 590 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.726436 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06901  multidrug ABC transporter  28.98 
 
 		 583 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.780793  normal  0.494245 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  30.02 
 
 		 577 aa  248  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0500  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.96 
 
 		 590 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0503  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.96 
 
 		 590 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  29.87 
 
 		 581 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  29.17 
 
 		 579 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  30.38 
 
 		 583 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  30.02 
 
 		 569 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2867  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.79 
 
 		 607 aa  243  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.52 
 
 		 590 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.79 
 
 		 588 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.89 
 
 		 588 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.62 
 
 		 588 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.14 
 
 		 593 aa  239  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.44 
 
 		 588 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  28.77 
 
 		 579 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09041  multidrug ABC transporter  29.9 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  29.12 
 
 		 650 aa  238  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  27.7 
 
 		 623 aa  238  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  29.1 
 
 		 606 aa  237  5.0000000000000005e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  27.99 
 
 		 579 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  27.4 
 
 		 658 aa  236  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.6 
 
 		 581 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  26.52 
 
 		 585 aa  235  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.82 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  30.33 
 
 		 600 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>