More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1468 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  100 
 
 
627 aa  1277    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  37.7 
 
 
611 aa  412  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  36.74 
 
 
569 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  38.82 
 
 
541 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  37.1 
 
 
569 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.81 
 
 
610 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  30.94 
 
 
583 aa  356  6.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  30.73 
 
 
586 aa  356  7.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  31.87 
 
 
582 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  37.34 
 
 
588 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  30.17 
 
 
586 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  34.92 
 
 
604 aa  336  9e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  33.66 
 
 
591 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  33.12 
 
 
584 aa  332  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  30.56 
 
 
589 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  31.93 
 
 
607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  34.53 
 
 
650 aa  327  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  32.67 
 
 
583 aa  326  9e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  31.5 
 
 
583 aa  325  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  30 
 
 
587 aa  325  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  32.33 
 
 
586 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  34.61 
 
 
603 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  35.08 
 
 
581 aa  320  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  31.19 
 
 
600 aa  320  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  29.19 
 
 
585 aa  319  7.999999999999999e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  33.22 
 
 
581 aa  319  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  32.45 
 
 
600 aa  319  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  30.74 
 
 
585 aa  317  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  30.23 
 
 
573 aa  317  6e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  34.63 
 
 
579 aa  316  8e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.72 
 
 
586 aa  316  8e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.67 
 
 
586 aa  316  9e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  32.72 
 
 
586 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  32.55 
 
 
586 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.72 
 
 
586 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.72 
 
 
586 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  32.55 
 
 
586 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.55 
 
 
586 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  29.7 
 
 
604 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 
548 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  29.88 
 
 
571 aa  313  9e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  33.66 
 
 
590 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  32.89 
 
 
598 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  31.36 
 
 
584 aa  310  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  32.84 
 
 
588 aa  310  5e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  30.29 
 
 
598 aa  309  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  30.99 
 
 
588 aa  307  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 
574 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  29.8 
 
 
581 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 
574 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  32.33 
 
 
598 aa  304  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  29.68 
 
 
596 aa  303  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  27.2 
 
 
592 aa  300  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.87 
 
 
583 aa  299  9e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  33.88 
 
 
607 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  28.75 
 
 
593 aa  299  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.97 
 
 
583 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  29.97 
 
 
583 aa  297  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  29.97 
 
 
583 aa  297  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.97 
 
 
583 aa  297  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  30.12 
 
 
583 aa  296  9e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.8 
 
 
583 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  29.97 
 
 
581 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09041  multidrug ABC transporter  29.87 
 
 
581 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09061  multidrug ABC transporter  29.36 
 
 
581 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  29.65 
 
 
583 aa  293  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  30.4 
 
 
583 aa  293  8e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.3 
 
 
583 aa  293  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06901  multidrug ABC transporter  29.21 
 
 
583 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.780793  normal  0.494245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  29.8 
 
 
583 aa  291  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  29.9 
 
 
583 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.97 
 
 
583 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0818  ABC transporter related  34.43 
 
 
569 aa  290  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153053  normal  0.572134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  31.6 
 
 
583 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  28.17 
 
 
573 aa  288  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  27.58 
 
 
606 aa  287  5e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  32.03 
 
 
572 aa  286  7e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  28.05 
 
 
589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  31.01 
 
 
583 aa  284  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.6 
 
 
601 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  32.03 
 
 
578 aa  283  9e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0038  ABC-type transport system, ATPase and permease components  33.76 
 
 
576 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  27.63 
 
 
577 aa  281  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.51 
 
 
580 aa  280  7e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  31.21 
 
 
579 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  30.08 
 
 
579 aa  277  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  30.99 
 
 
641 aa  277  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  27.63 
 
 
577 aa  276  7e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0833  ABC transporter related  32.64 
 
 
612 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0369945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  32.68 
 
 
589 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  32.02 
 
 
606 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.27 
 
 
586 aa  270  8e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.77 
 
 
555 aa  270  8e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  29.68 
 
 
594 aa  270  8.999999999999999e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  29.35 
 
 
594 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  29.18 
 
 
579 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  28.78 
 
 
593 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  27.37 
 
 
618 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.64 
 
 
593 aa  265  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.07 
 
 
581 aa  262  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>