More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3410 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  100 
 
 		 588 aa  1157    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  58.01 
 
 		 604 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  51.06 
 
 		 569 aa  571  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  52.96 
 
 		 541 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  50.26 
 
 		 611 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  50.88 
 
 		 569 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  52.71 
 
 		 610 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  38.21 
 
 		 589 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  37.92 
 
 		 579 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  36.91 
 
 		 598 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  33.5 
 
 		 585 aa  364  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  34.13 
 
 		 582 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  37.34 
 
 		 627 aa  359  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 650 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  34.52 
 
 		 591 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0038  ABC-type transport system, ATPase and permease components  40.07 
 
 		 576 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  38.37 
 
 		 590 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  34.15 
 
 		 573 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  34.37 
 
 		 641 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  36.62 
 
 		 581 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  32.99 
 
 		 598 aa  343  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  34.18 
 
 		 588 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  30.69 
 
 		 573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  33.39 
 
 		 581 aa  338  1.9999999999999998e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  33.28 
 
 		 596 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  36.11 
 
 		 607 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  38.46 
 
 		 600 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  35.98 
 
 		 603 aa  336  9e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  33.04 
 
 		 586 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.87 
 
 		 586 aa  333  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  32.87 
 
 		 586 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  35.16 
 
 		 583 aa  333  7.000000000000001e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  34.25 
 
 		 571 aa  332  8e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09061  multidrug ABC transporter  35.1 
 
 		 581 aa  333  8e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  35.21 
 
 		 583 aa  332  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  35.29 
 
 		 607 aa  331  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.87 
 
 		 586 aa  332  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  35.1 
 
 		 581 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  30.27 
 
 		 592 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  34.81 
 
 		 584 aa  330  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  35.26 
 
 		 581 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  33.45 
 
 		 583 aa  330  4e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  35.24 
 
 		 583 aa  330  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  35.58 
 
 		 574 aa  330  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  32.7 
 
 		 586 aa  329  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.7 
 
 		 586 aa  329  8e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  35.68 
 
 		 574 aa  329  9e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 		 586 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.7 
 
 		 586 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  36.15 
 
 		 578 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  32.14 
 
 		 587 aa  327  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  37.26 
 
 		 598 aa  327  3e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09041  multidrug ABC transporter  35.63 
 
 		 581 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  32.55 
 
 		 593 aa  327  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  37.06 
 
 		 588 aa  326  9e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  36.97 
 
 		 572 aa  325  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  32.55 
 
 		 606 aa  325  1e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  32.12 
 
 		 584 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  31.8 
 
 		 586 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  31.34 
 
 		 586 aa  323  4e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  32.2 
 
 		 604 aa  323  7e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  31.58 
 
 		 585 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  36.77 
 
 		 580 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06901  multidrug ABC transporter  35.47 
 
 		 583 aa  319  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.780793  normal  0.494245 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.89 
 
 		 548 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  36.2 
 
 		 600 aa  317  5e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  31.42 
 
 		 586 aa  316  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  32.86 
 
 		 577 aa  316  9e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  37.06 
 
 		 583 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  34.72 
 
 		 583 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  31.79 
 
 		 594 aa  309  6.999999999999999e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  32.86 
 
 		 577 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  31.41 
 
 		 589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  33.45 
 
 		 623 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  34.72 
 
 		 583 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.99 
 
 		 593 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  28.92 
 
 		 581 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  31.75 
 
 		 593 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  34.74 
 
 		 601 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  30.42 
 
 		 581 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0818  ABC transporter related  37.86 
 
 		 569 aa  301  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153053  normal  0.572134 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.95 
 
 		 580 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.99 
 
 		 588 aa  297  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.21 
 
 		 581 aa  294  3e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.27 
 
 		 555 aa  294  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  30.73 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  33.62 
 
 		 579 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.55 
 
 		 591 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.58 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.85 
 
 		 590 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  32.02 
 
 		 590 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  32.02 
 
 		 590 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  30.66 
 
 		 583 aa  290  6e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.67 
 
 		 590 aa  289  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0509  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.92 
 
 		 590 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.726436 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.53 
 
 		 583 aa  289  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0519  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.92 
 
 		 590 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0563  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.68 
 
 		 590 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0503  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.92 
 
 		 590 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.35 
 
 		 583 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>