More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2782 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
596 aa  1209    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1769  ABC transporter related  42.33 
 
 
614 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1304  ABC transporter related  40.2 
 
 
602 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1984  ABC transporter related  38.96 
 
 
605 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19290  ABC transporter related  57.32 
 
 
329 aa  363  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.715908  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  36.97 
 
 
586 aa  348  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  34.95 
 
 
587 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  36.88 
 
 
582 aa  343  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  33.89 
 
 
586 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  33.5 
 
 
583 aa  330  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.75 
 
 
581 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  35.19 
 
 
618 aa  325  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  34.56 
 
 
589 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.39 
 
 
601 aa  323  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  32.44 
 
 
587 aa  323  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  29.58 
 
 
579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  34.57 
 
 
600 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  32.83 
 
 
588 aa  322  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  37.05 
 
 
579 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  34.3 
 
 
588 aa  320  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31.42 
 
 
581 aa  320  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  32.78 
 
 
589 aa  320  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  33.84 
 
 
591 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  36.35 
 
 
581 aa  317  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  33.67 
 
 
606 aa  317  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  37.31 
 
 
596 aa  317  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  33.11 
 
 
589 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 
604 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  34.28 
 
 
606 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  32.32 
 
 
611 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.01 
 
 
584 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  36.03 
 
 
583 aa  312  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  35.33 
 
 
585 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  33.45 
 
 
592 aa  311  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  34.23 
 
 
585 aa  310  4e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.97 
 
 
575 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  35.54 
 
 
604 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.11 
 
 
609 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  34.6 
 
 
594 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  31.11 
 
 
610 aa  307  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2670  ABC transporter related  33.21 
 
 
622 aa  306  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292907  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.43 
 
 
578 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.43 
 
 
578 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  31.59 
 
 
578 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  33 
 
 
598 aa  302  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  31.12 
 
 
583 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  34.36 
 
 
580 aa  301  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  33.45 
 
 
592 aa  300  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  29.97 
 
 
608 aa  300  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  32.18 
 
 
581 aa  299  8e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  30.19 
 
 
613 aa  299  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  34.38 
 
 
642 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7143  ABC transporter related  33.46 
 
 
587 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.29 
 
 
586 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.29 
 
 
586 aa  298  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  32.25 
 
 
620 aa  297  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  30.91 
 
 
594 aa  296  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  31.13 
 
 
607 aa  296  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.78 
 
 
586 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  31.45 
 
 
593 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.78 
 
 
586 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  33.67 
 
 
573 aa  295  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.78 
 
 
586 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.61 
 
 
586 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.61 
 
 
586 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  32.67 
 
 
600 aa  294  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.12 
 
 
636 aa  294  3e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  32.71 
 
 
598 aa  294  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.44 
 
 
586 aa  294  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  29.61 
 
 
586 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.61 
 
 
586 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  32.55 
 
 
588 aa  293  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  31.93 
 
 
584 aa  293  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.88 
 
 
583 aa  293  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  31.98 
 
 
624 aa  293  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  32.06 
 
 
596 aa  293  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  34.43 
 
 
579 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  30.45 
 
 
583 aa  292  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  30.29 
 
 
590 aa  292  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5994  ABC transporter related  32.36 
 
 
587 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
571 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  29.05 
 
 
583 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.33 
 
 
571 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  29.05 
 
 
583 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  29.05 
 
 
583 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  33.4 
 
 
581 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.05 
 
 
583 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
571 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  34.27 
 
 
575 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 
571 aa  291  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  30.73 
 
 
578 aa  291  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.4 
 
 
583 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
571 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.33 
 
 
571 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.33 
 
 
571 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  30.68 
 
 
597 aa  290  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  30.68 
 
 
597 aa  290  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
571 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  29.34 
 
 
614 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.98 
 
 
577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>