More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1304 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1304  ABC transporter related  100 
 
 		 602 aa  1207    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.2 
 
 		 596 aa  462  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1984  ABC transporter related  38.26 
 
 		 605 aa  458  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1769  ABC transporter related  41.4 
 
 		 614 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  36.64 
 
 		 582 aa  365  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.76 
 
 		 578 aa  360  6e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.76 
 
 		 578 aa  360  6e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  38.19 
 
 		 586 aa  350  6e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19290  ABC transporter related  49.23 
 
 		 329 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.715908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.69 
 
 		 584 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.84 
 
 		 578 aa  344  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  34.57 
 
 		 587 aa  340  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  36.98 
 
 		 586 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.83 
 
 		 581 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  33.61 
 
 		 600 aa  334  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  34.19 
 
 		 580 aa  333  6e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  31.33 
 
 		 611 aa  333  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  34.54 
 
 		 588 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  35.37 
 
 		 585 aa  331  3e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  33.44 
 
 		 591 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 579 aa  328  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  33.11 
 
 		 588 aa  328  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  34.28 
 
 		 589 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  33.33 
 
 		 584 aa  327  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  32.17 
 
 		 601 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.38 
 
 		 586 aa  326  7e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.71 
 
 		 556 aa  326  8.000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  32.25 
 
 		 580 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  32.53 
 
 		 598 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  37.3 
 
 		 583 aa  325  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.27 
 
 		 586 aa  325  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  32.86 
 
 		 618 aa  325  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  35.79 
 
 		 588 aa  324  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.28 
 
 		 601 aa  324  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.05 
 
 		 586 aa  323  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  32.71 
 
 		 572 aa  323  5e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.05 
 
 		 586 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  34.01 
 
 		 584 aa  323  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.88 
 
 		 586 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.68 
 
 		 597 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.88 
 
 		 617 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.68 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  36.68 
 
 		 583 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.89 
 
 		 586 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  31.88 
 
 		 586 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.35 
 
 		 597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.88 
 
 		 586 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  34.59 
 
 		 594 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  33.17 
 
 		 606 aa  322  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  32.33 
 
 		 586 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  30.26 
 
 		 603 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  33.5 
 
 		 596 aa  320  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  34.21 
 
 		 589 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  37.18 
 
 		 642 aa  320  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.71 
 
 		 586 aa  320  7e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.71 
 
 		 586 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  36.65 
 
 		 573 aa  319  7.999999999999999e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  32.07 
 
 		 578 aa  319  7.999999999999999e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  32.82 
 
 		 572 aa  319  7.999999999999999e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  34.77 
 
 		 604 aa  318  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.02 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  30.02 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31.64 
 
 		 581 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  34.89 
 
 		 589 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  36.47 
 
 		 641 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.76 
 
 		 573 aa  316  8e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  32.22 
 
 		 604 aa  316  8e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  33.97 
 
 		 583 aa  316  9e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  30.34 
 
 		 603 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  31.07 
 
 		 583 aa  316  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  33.67 
 
 		 592 aa  315  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  33 
 
 		 607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.1 
 
 		 598 aa  314  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  34.56 
 
 		 577 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  31.33 
 
 		 581 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  31.45 
 
 		 601 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  31.01 
 
 		 591 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  34.22 
 
 		 607 aa  313  9e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  31.28 
 
 		 601 aa  313  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  32.41 
 
 		 606 aa  312  1e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  34.29 
 
 		 577 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.67 
 
 		 593 aa  312  1e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  30.31 
 
 		 581 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  33 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.91 
 
 		 571 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.91 
 
 		 571 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.91 
 
 		 571 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  30.91 
 
 		 586 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.59 
 
 		 571 aa  310  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  34.97 
 
 		 584 aa  310  5e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.2 
 
 		 571 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  31.95 
 
 		 602 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.2 
 
 		 571 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.03 
 
 		 571 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  32.19 
 
 		 593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.86 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  31.97 
 
 		 577 aa  307  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  32.99 
 
 		 578 aa  307  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  34.22 
 
 		 590 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.91 
 
 		 571 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>