More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1769 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1769  ABC transporter related  100 
 
 		 614 aa  1257    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624657  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.6 
 
 		 596 aa  481  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1304  ABC transporter related  41.4 
 
 		 602 aa  460  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1984  ABC transporter related  38.54 
 
 		 605 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  37.87 
 
 		 600 aa  362  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  36.39 
 
 		 582 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  35.8 
 
 		 587 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19290  ABC transporter related  52.45 
 
 		 329 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.715908  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 588 aa  330  6e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  35.88 
 
 		 586 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  35.07 
 
 		 588 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  37.05 
 
 		 585 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  36.76 
 
 		 583 aa  326  8.000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  32.38 
 
 		 581 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  34.44 
 
 		 586 aa  325  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  35.37 
 
 		 591 aa  324  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  33.05 
 
 		 581 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.73 
 
 		 589 aa  321  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  37.12 
 
 		 642 aa  318  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  32.18 
 
 		 588 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.78 
 
 		 606 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  34.44 
 
 		 601 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  33.61 
 
 		 585 aa  314  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  32.2 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  35.77 
 
 		 641 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  31.77 
 
 		 611 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  33.44 
 
 		 593 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  33.28 
 
 		 592 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.65 
 
 		 597 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  36.74 
 
 		 595 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.53 
 
 		 586 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  30.48 
 
 		 589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  32.31 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  31.66 
 
 		 593 aa  307  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.7 
 
 		 586 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  36.77 
 
 		 594 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  33.83 
 
 		 606 aa  306  6e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2670  ABC transporter related  32.3 
 
 		 622 aa  306  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292907  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  31.28 
 
 		 578 aa  306  8.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.6 
 
 		 586 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  32.06 
 
 		 580 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.42 
 
 		 587 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  34.78 
 
 		 604 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5994  ABC transporter related  35.1 
 
 		 587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  32.97 
 
 		 618 aa  304  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  35.7 
 
 		 583 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 579 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.38 
 
 		 575 aa  303  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.48 
 
 		 586 aa  302  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.19 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.19 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.19 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  35.71 
 
 		 572 aa  301  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7143  ABC transporter related  34.96 
 
 		 587 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  29.03 
 
 		 586 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.03 
 
 		 586 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  31.38 
 
 		 588 aa  300  7e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  32.32 
 
 		 596 aa  299  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  31.04 
 
 		 584 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.19 
 
 		 586 aa  298  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 		 604 aa  297  4e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  31.37 
 
 		 579 aa  296  7e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  31.3 
 
 		 583 aa  296  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30.69 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  30 
 
 		 596 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  32.94 
 
 		 577 aa  294  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  28.55 
 
 		 586 aa  294  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  30.05 
 
 		 596 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.77 
 
 		 596 aa  293  6e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  32.7 
 
 		 584 aa  293  7e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  31.29 
 
 		 584 aa  293  8e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.08 
 
 		 597 aa  292  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.67 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  34.1 
 
 		 589 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.08 
 
 		 597 aa  291  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.17 
 
 		 609 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  30.36 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  29.59 
 
 		 603 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  31.34 
 
 		 581 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.88 
 
 		 595 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.48 
 
 		 577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  33.16 
 
 		 573 aa  289  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.91 
 
 		 583 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 569 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.81 
 
 		 608 aa  287  4e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.69 
 
 		 617 aa  287  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  29.11 
 
 		 596 aa  287  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.07 
 
 		 586 aa  287  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  30.17 
 
 		 583 aa  287  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  30.55 
 
 		 575 aa  286  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  30.11 
 
 		 583 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  30.11 
 
 		 583 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.11 
 
 		 583 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.01 
 
 		 573 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  34.3 
 
 		 571 aa  286  8e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.09 
 
 		 556 aa  286  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.11 
 
 		 583 aa  286  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  30.46 
 
 		 583 aa  286  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  31.68 
 
 		 607 aa  286  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.2 
 
 		 583 aa  286  9e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>