More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2670 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5994  ABC transporter related  78.84 
 
 
587 aa  931    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2670  ABC transporter related  100 
 
 
622 aa  1262    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292907  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7143  ABC transporter related  78.16 
 
 
587 aa  923    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  39.76 
 
 
588 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  39.53 
 
 
592 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38.27 
 
 
606 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.9 
 
 
601 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  37.13 
 
 
642 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  38.04 
 
 
581 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  37.52 
 
 
587 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.1 
 
 
586 aa  363  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  35.27 
 
 
586 aa  361  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.04 
 
 
586 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.34 
 
 
586 aa  360  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  35.4 
 
 
641 aa  356  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.87 
 
 
586 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.87 
 
 
586 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.69 
 
 
586 aa  356  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  34.87 
 
 
586 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.87 
 
 
586 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.06 
 
 
584 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.51 
 
 
586 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.26 
 
 
598 aa  353  5.9999999999999994e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.77 
 
 
578 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.77 
 
 
578 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
572 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.55 
 
 
586 aa  351  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  33.45 
 
 
581 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  36.16 
 
 
572 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  35.95 
 
 
589 aa  342  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.75 
 
 
581 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.95 
 
 
556 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  35.95 
 
 
567 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  32.12 
 
 
580 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  33.79 
 
 
585 aa  336  7e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.32 
 
 
575 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.43 
 
 
567 aa  335  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.79 
 
 
598 aa  333  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  33.67 
 
 
575 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  35.13 
 
 
600 aa  328  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  37.74 
 
 
581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.97 
 
 
572 aa  327  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  33.97 
 
 
572 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  34.39 
 
 
594 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  32.67 
 
 
650 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  33.97 
 
 
572 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.9 
 
 
567 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  36.46 
 
 
601 aa  326  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  33.74 
 
 
601 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  32.24 
 
 
604 aa  325  1e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  33.39 
 
 
660 aa  325  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.2 
 
 
579 aa  324  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  33.05 
 
 
598 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 
566 aa  323  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  33.39 
 
 
568 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  32.55 
 
 
566 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.98 
 
 
584 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  32.62 
 
 
582 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  31.94 
 
 
644 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  35.07 
 
 
576 aa  321  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.51 
 
 
571 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  34.13 
 
 
591 aa  320  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.35 
 
 
594 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.91 
 
 
578 aa  320  5e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.52 
 
 
627 aa  320  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.4 
 
 
571 aa  320  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.4 
 
 
571 aa  320  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.4 
 
 
571 aa  320  6e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.4 
 
 
571 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.57 
 
 
571 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  35.77 
 
 
610 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3781  ABC transporter, ATPase subunit  34.54 
 
 
626 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.4 
 
 
571 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  31.83 
 
 
588 aa  318  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  33.94 
 
 
577 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.34 
 
 
571 aa  317  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  33.33 
 
 
603 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  31.3 
 
 
582 aa  317  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.72 
 
 
572 aa  317  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  32.41 
 
 
587 aa  316  7e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  35.93 
 
 
582 aa  316  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.21 
 
 
596 aa  315  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.22 
 
 
571 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  33.22 
 
 
580 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  36.14 
 
 
582 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.22 
 
 
571 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.59 
 
 
577 aa  316  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  32.52 
 
 
591 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  35.04 
 
 
598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  35.16 
 
 
580 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  34.76 
 
 
773 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  32.38 
 
 
607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  33.1 
 
 
586 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  33.68 
 
 
617 aa  314  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.25 
 
 
597 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  32.25 
 
 
596 aa  313  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  34.57 
 
 
625 aa  313  6.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  31.37 
 
 
583 aa  313  6.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  32.61 
 
 
591 aa  313  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0351  hypothetical protein  32.84 
 
 
611 aa  312  1e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.378963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>