More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1860 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  100 
 
 		 584 aa  1174    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  72.6 
 
 		 584 aa  898    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.66 
 
 		 609 aa  432  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  38.66 
 
 		 610 aa  432  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 575 aa  412  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  40.31 
 
 		 585 aa  398  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.89 
 
 		 598 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.94 
 
 		 597 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  37.78 
 
 		 598 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.98 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  38.7 
 
 		 602 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  35.47 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2435  ABC transporter, transmembrane region  39.49 
 
 		 600 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  37.91 
 
 		 611 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.6 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  38.75 
 
 		 598 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  35.78 
 
 		 586 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.09 
 
 		 586 aa  365  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.09 
 
 		 586 aa  365  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.92 
 
 		 586 aa  364  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.92 
 
 		 586 aa  364  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.92 
 
 		 586 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  34.75 
 
 		 586 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.75 
 
 		 586 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  38.62 
 
 		 597 aa  362  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4333  ABC transporter related  39.14 
 
 		 625 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.131034 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.37 
 
 		 594 aa  360  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 586 aa  360  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.14 
 
 		 606 aa  360  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4273  ABC transporter related  39.24 
 
 		 625 aa  360  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  37.91 
 
 		 575 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.31 
 
 		 601 aa  357  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.83 
 
 		 571 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  40.43 
 
 		 618 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.2 
 
 		 596 aa  356  7.999999999999999e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.73 
 
 		 597 aa  356  7.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.73 
 
 		 597 aa  356  7.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.14 
 
 		 601 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.66 
 
 		 571 aa  355  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.66 
 
 		 571 aa  355  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.66 
 
 		 571 aa  355  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.22 
 
 		 589 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.91 
 
 		 579 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.14 
 
 		 578 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.14 
 
 		 578 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.56 
 
 		 597 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 		 571 aa  353  5e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.48 
 
 		 571 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  36.38 
 
 		 589 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.32 
 
 		 602 aa  353  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  36.18 
 
 		 620 aa  353  7e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  34.66 
 
 		 571 aa  353  7e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  35.71 
 
 		 617 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.66 
 
 		 571 aa  352  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  34.48 
 
 		 571 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 		 571 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  38.02 
 
 		 588 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35.98 
 
 		 625 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.81 
 
 		 585 aa  350  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.28 
 
 		 586 aa  350  6e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.64 
 
 		 598 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  37.02 
 
 		 641 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  36.49 
 
 		 600 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.19 
 
 		 579 aa  345  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  36.97 
 
 		 640 aa  344  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.12 
 
 		 598 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  35.75 
 
 		 600 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  37 
 
 		 611 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.12 
 
 		 598 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.19 
 
 		 603 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1126  ABC transporter-related protein  38.37 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  37.05 
 
 		 611 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  35.23 
 
 		 648 aa  342  1e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.43 
 
 		 628 aa  341  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.9 
 
 		 586 aa  341  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.12 
 
 		 598 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  38.71 
 
 		 586 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  33.33 
 
 		 589 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 636 aa  340  5e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  34.64 
 
 		 613 aa  340  5e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.13 
 
 		 580 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  31.88 
 
 		 609 aa  340  5.9999999999999996e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.43 
 
 		 608 aa  340  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.56 
 
 		 578 aa  339  8e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.64 
 
 		 598 aa  339  9e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  32.64 
 
 		 598 aa  339  9e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.64 
 
 		 598 aa  339  9e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  32.87 
 
 		 594 aa  339  9e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  36.49 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  37.21 
 
 		 582 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  37.93 
 
 		 586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.81 
 
 		 611 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  36.64 
 
 		 588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.19 
 
 		 580 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.21 
 
 		 572 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  35.28 
 
 		 600 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.47 
 
 		 598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.47 
 
 		 598 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  31.75 
 
 		 600 aa  337  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  37.76 
 
 		 625 aa  336  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>