More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4273 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4273  ABC transporter related  100 
 
 
625 aa  1263    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2435  ABC transporter, transmembrane region  63.97 
 
 
600 aa  730    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4333  ABC transporter related  99.68 
 
 
625 aa  1260    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1991  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  43 
 
 
611 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0980803  normal  0.606679 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  40.9 
 
 
610 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.9 
 
 
609 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.17 
 
 
676 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.428609  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2796  ABC transporter related  40.11 
 
 
580 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00139459  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  39.37 
 
 
618 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  37.5 
 
 
584 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  36.73 
 
 
611 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  39.24 
 
 
584 aa  379  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.38 
 
 
556 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  37.35 
 
 
575 aa  369  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  37.21 
 
 
602 aa  364  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  38.57 
 
 
584 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.31 
 
 
598 aa  352  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.62 
 
 
577 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.73 
 
 
587 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  37.23 
 
 
575 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.62 
 
 
586 aa  345  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.97 
 
 
582 aa  345  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.13 
 
 
586 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.79 
 
 
586 aa  343  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.79 
 
 
586 aa  343  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  35.56 
 
 
597 aa  342  9e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.91 
 
 
578 aa  342  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.91 
 
 
578 aa  342  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 
586 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33.79 
 
 
586 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.79 
 
 
586 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.08 
 
 
586 aa  340  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  33.62 
 
 
586 aa  340  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  34.19 
 
 
584 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.92 
 
 
578 aa  339  8e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.87 
 
 
586 aa  339  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.62 
 
 
586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.96 
 
 
580 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 
598 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.94 
 
 
572 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.12 
 
 
597 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.55 
 
 
598 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  36.08 
 
 
585 aa  333  8e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  37.35 
 
 
608 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  35.43 
 
 
575 aa  330  6e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.93 
 
 
598 aa  330  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.04 
 
 
579 aa  330  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.94 
 
 
594 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  36.36 
 
 
614 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.41 
 
 
598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.45 
 
 
580 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  36.99 
 
 
578 aa  327  3e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.49 
 
 
598 aa  328  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  35.07 
 
 
625 aa  327  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  32.24 
 
 
598 aa  327  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.24 
 
 
598 aa  327  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  32.39 
 
 
609 aa  327  5e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.24 
 
 
598 aa  327  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.24 
 
 
598 aa  327  6e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  34.87 
 
 
572 aa  326  6e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  33.39 
 
 
625 aa  326  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  34.7 
 
 
572 aa  326  8.000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  33.1 
 
 
605 aa  325  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  37.67 
 
 
598 aa  323  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.93 
 
 
585 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  32.25 
 
 
581 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  38.18 
 
 
578 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  33.45 
 
 
617 aa  321  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.68 
 
 
583 aa  320  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.19 
 
 
594 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  31.9 
 
 
598 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  34.89 
 
 
624 aa  318  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8971  ABC transporter related protein  35.79 
 
 
623 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  37.15 
 
 
550 aa  317  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  34.86 
 
 
609 aa  317  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.04 
 
 
597 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  36.78 
 
 
546 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  35.28 
 
 
617 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  34.1 
 
 
609 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  35.24 
 
 
620 aa  316  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  36.96 
 
 
597 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  30.85 
 
 
582 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.95 
 
 
597 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.34 
 
 
589 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  33.67 
 
 
600 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.04 
 
 
597 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.96 
 
 
596 aa  314  3.9999999999999997e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  34.18 
 
 
597 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  33.05 
 
 
577 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  35.49 
 
 
588 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  34.36 
 
 
601 aa  313  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  34.58 
 
 
566 aa  313  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.15 
 
 
571 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  32.66 
 
 
601 aa  312  9e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.27 
 
 
600 aa  312  9e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  32.83 
 
 
634 aa  312  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  34.78 
 
 
609 aa  312  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3684  ABC transporter related  34.43 
 
 
714 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.66 
 
 
606 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  34.41 
 
 
601 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0190935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>