More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3684 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3684  ABC transporter related  100 
 
 		 714 aa  1439    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2288  ABC transporter related  79.92 
 
 		 704 aa  1083    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418994  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3455  ABC transporter related  73.16 
 
 		 705 aa  892    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0337574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3192  ABC transporter related  77.95 
 
 		 701 aa  1052    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678636  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1534  ABC transporter related  73.3 
 
 		 668 aa  887    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5078  putative ABC transporter, ATPase and permease components  69.26 
 
 		 690 aa  919    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  35.48 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.5 
 
 		 602 aa  333  1e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.14 
 
 		 586 aa  331  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.51 
 
 		 597 aa  330  6e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.14 
 
 		 586 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.97 
 
 		 586 aa  327  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.85 
 
 		 584 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.62 
 
 		 586 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.27 
 
 		 586 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.44 
 
 		 586 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.44 
 
 		 586 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.79 
 
 		 579 aa  321  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  34.27 
 
 		 586 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.27 
 
 		 586 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.86 
 
 		 567 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  33.8 
 
 		 576 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  35.97 
 
 		 567 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  34.73 
 
 		 593 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 618 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3364  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.44 
 
 		 772 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.44 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  34.41 
 
 		 597 aa  311  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  35.29 
 
 		 635 aa  310  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.14 
 
 		 584 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.04 
 
 		 577 aa  310  9e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  33.16 
 
 		 578 aa  309  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  33.16 
 
 		 578 aa  309  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3103  ABC transporter related  35.18 
 
 		 696 aa  308  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.08 
 
 		 601 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.63 
 
 		 571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  33.98 
 
 		 572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.85 
 
 		 587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.81 
 
 		 571 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  34.13 
 
 		 610 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.37 
 
 		 586 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.51 
 
 		 597 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.86 
 
 		 572 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.51 
 
 		 597 aa  304  5.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.35 
 
 		 608 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.63 
 
 		 571 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  34.66 
 
 		 582 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.63 
 
 		 571 aa  303  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.63 
 
 		 571 aa  303  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.63 
 
 		 571 aa  303  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  35.57 
 
 		 601 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.52 
 
 		 567 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 620 aa  302  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  33.18 
 
 		 660 aa  301  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  34.9 
 
 		 582 aa  301  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  36.25 
 
 		 594 aa  300  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  33.53 
 
 		 612 aa  300  5e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  37.57 
 
 		 575 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.99 
 
 		 571 aa  300  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31.34 
 
 		 581 aa  300  8e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.46 
 
 		 571 aa  299  9e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.46 
 
 		 571 aa  299  9e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.09 
 
 		 575 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.46 
 
 		 571 aa  298  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  36.18 
 
 		 650 aa  297  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  33.63 
 
 		 566 aa  297  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  33.1 
 
 		 572 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  33.93 
 
 		 580 aa  297  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  34.55 
 
 		 582 aa  296  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.5 
 
 		 676 aa  295  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.428609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  32.65 
 
 		 600 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  31.89 
 
 		 597 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  34.89 
 
 		 611 aa  295  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  38.12 
 
 		 611 aa  295  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  32.5 
 
 		 572 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  31.85 
 
 		 579 aa  294  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  33.61 
 
 		 601 aa  294  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  32.5 
 
 		 572 aa  294  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.67 
 
 		 578 aa  293  6e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.21 
 
 		 628 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  37.13 
 
 		 591 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  31.89 
 
 		 628 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.5 
 
 		 572 aa  292  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  33.22 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  33.1 
 
 		 607 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  36.15 
 
 		 611 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  34.33 
 
 		 565 aa  291  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.97 
 
 		 596 aa  290  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  32.4 
 
 		 589 aa  290  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  30.87 
 
 		 628 aa  290  6e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  34.35 
 
 		 623 aa  290  7e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  32.88 
 
 		 601 aa  290  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  31.71 
 
 		 582 aa  290  9e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  31.24 
 
 		 638 aa  290  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.52 
 
 		 614 aa  290  9e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  36.76 
 
 		 578 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  32.28 
 
 		 636 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0526  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.94 
 
 		 592 aa  288  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000230499  normal  0.803212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  33.68 
 
 		 609 aa  289  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>