More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3192 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3684  ABC transporter related  77.87 
 
 		 714 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2288  ABC transporter related  86.44 
 
 		 704 aa  1166    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418994  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3455  ABC transporter related  74.11 
 
 		 705 aa  938    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0337574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3192  ABC transporter related  100 
 
 		 701 aa  1413    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678636  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1534  ABC transporter related  77.39 
 
 		 668 aa  910    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5078  putative ABC transporter, ATPase and permease components  74.05 
 
 		 690 aa  949    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  36.85 
 
 		 586 aa  340  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.87 
 
 		 586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.87 
 
 		 586 aa  336  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.87 
 
 		 586 aa  335  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.35 
 
 		 586 aa  331  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.35 
 
 		 586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.35 
 
 		 586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.52 
 
 		 586 aa  330  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  36.17 
 
 		 586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.17 
 
 		 586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.61 
 
 		 602 aa  327  5e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3364  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.32 
 
 		 772 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.68 
 
 		 597 aa  320  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 620 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  33.33 
 
 		 576 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  34.13 
 
 		 584 aa  313  9e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.62 
 
 		 579 aa  312  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  34.23 
 
 		 594 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  32.93 
 
 		 618 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  35.38 
 
 		 593 aa  310  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  35.74 
 
 		 597 aa  310  8e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.89 
 
 		 598 aa  309  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  35.43 
 
 		 582 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.55 
 
 		 586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.63 
 
 		 571 aa  306  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  33.06 
 
 		 580 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3103  ABC transporter related  35.08 
 
 		 696 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.65 
 
 		 597 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  35.54 
 
 		 587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.09 
 
 		 567 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.51 
 
 		 571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.4 
 
 		 571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  35.08 
 
 		 582 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  35 
 
 		 610 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.4 
 
 		 571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.4 
 
 		 571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  33.97 
 
 		 572 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.4 
 
 		 571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  33.22 
 
 		 600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.6 
 
 		 567 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.94 
 
 		 584 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.57 
 
 		 571 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  32.92 
 
 		 572 aa  303  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  32.92 
 
 		 572 aa  302  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.78 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.78 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.92 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  33.33 
 
 		 615 aa  301  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  32.47 
 
 		 582 aa  301  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.16 
 
 		 575 aa  301  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.51 
 
 		 572 aa  300  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  35.2 
 
 		 571 aa  300  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.2 
 
 		 571 aa  300  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  34.48 
 
 		 1522 aa  300  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.2 
 
 		 571 aa  299  9e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.46 
 
 		 578 aa  299  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.57 
 
 		 617 aa  299  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.99 
 
 		 566 aa  299  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.46 
 
 		 578 aa  299  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.3 
 
 		 608 aa  299  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  32.02 
 
 		 572 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  34.2 
 
 		 1003 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  33.65 
 
 		 612 aa  298  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 598 aa  298  2e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.28 
 
 		 676 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.428609  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 577 aa  296  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  36.6 
 
 		 591 aa  296  7e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  35.66 
 
 		 601 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  33.91 
 
 		 601 aa  296  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  34.43 
 
 		 582 aa  296  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  31.9 
 
 		 579 aa  296  9e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  32.86 
 
 		 607 aa  296  9e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.88 
 
 		 566 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  31.99 
 
 		 648 aa  295  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.45 
 
 		 601 aa  295  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  35.71 
 
 		 611 aa  294  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31.9 
 
 		 581 aa  294  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.88 
 
 		 577 aa  294  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  34.2 
 
 		 566 aa  294  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  35.18 
 
 		 660 aa  293  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  33.46 
 
 		 619 aa  293  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  36.2 
 
 		 601 aa  292  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  32.14 
 
 		 628 aa  291  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.03 
 
 		 567 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.25 
 
 		 1024 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  34.26 
 
 		 700 aa  290  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  33.28 
 
 		 623 aa  290  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  38.03 
 
 		 611 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  31.68 
 
 		 581 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  34.08 
 
 		 653 aa  290  7e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  33.46 
 
 		 663 aa  290  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.91 
 
 		 556 aa  290  8e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  30.39 
 
 		 638 aa  290  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  34.09 
 
 		 624 aa  289  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>