More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3103 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3103  ABC transporter related  100 
 
 
696 aa  1434    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519586  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3684  ABC transporter related  35.25 
 
 
714 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2288  ABC transporter related  35.28 
 
 
704 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418994  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3192  ABC transporter related  35.09 
 
 
701 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678636  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1534  ABC transporter related  35.12 
 
 
668 aa  290  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  36.97 
 
 
587 aa  279  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.07 
 
 
597 aa  275  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  35.94 
 
 
597 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  32.27 
 
 
582 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.93 
 
 
575 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.65 
 
 
598 aa  269  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.24 
 
 
586 aa  266  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.24 
 
 
586 aa  265  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  32.87 
 
 
594 aa  264  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  34.59 
 
 
598 aa  264  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  33.14 
 
 
584 aa  264  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  32.97 
 
 
613 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  30.36 
 
 
586 aa  261  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5078  putative ABC transporter, ATPase and permease components  34.89 
 
 
690 aa  261  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.73 
 
 
586 aa  260  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.11 
 
 
579 aa  260  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.73 
 
 
586 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.73 
 
 
586 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.56 
 
 
586 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.08 
 
 
579 aa  258  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  35.93 
 
 
611 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.56 
 
 
586 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.21 
 
 
578 aa  258  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.21 
 
 
578 aa  258  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.56 
 
 
586 aa  258  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3455  ABC transporter related  35.67 
 
 
705 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0337574  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  31.87 
 
 
584 aa  257  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  32.29 
 
 
620 aa  256  7e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.11 
 
 
1019 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.98 
 
 
671 aa  256  9e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  33.28 
 
 
588 aa  256  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.08 
 
 
608 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.93 
 
 
609 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  32.93 
 
 
610 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.39 
 
 
586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  32.79 
 
 
584 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  32.28 
 
 
593 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 
619 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  33.78 
 
 
640 aa  254  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.06 
 
 
591 aa  254  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.07 
 
 
614 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.41 
 
 
578 aa  253  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.14 
 
 
586 aa  252  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  31.74 
 
 
628 aa  252  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  31.71 
 
 
572 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  29.33 
 
 
581 aa  251  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  33.9 
 
 
611 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4333  ABC transporter related  34.83 
 
 
625 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  30.86 
 
 
617 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  31.73 
 
 
612 aa  251  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  30.7 
 
 
603 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  32.32 
 
 
606 aa  250  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  32.09 
 
 
764 aa  250  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4273  ABC transporter related  34.83 
 
 
625 aa  250  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  32.47 
 
 
606 aa  250  8e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  33.52 
 
 
611 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  30.41 
 
 
648 aa  249  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.6 
 
 
572 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  30.45 
 
 
593 aa  249  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  31.75 
 
 
650 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.44 
 
 
572 aa  248  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.77 
 
 
601 aa  248  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.62 
 
 
632 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  28.99 
 
 
592 aa  248  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  31.27 
 
 
592 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.89 
 
 
580 aa  246  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  29.75 
 
 
622 aa  246  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  30.83 
 
 
629 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  32.09 
 
 
601 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.71 
 
 
571 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.4 
 
 
571 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.4 
 
 
571 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  31.83 
 
 
638 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.4 
 
 
571 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  32.67 
 
 
728 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.4 
 
 
571 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.4 
 
 
571 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.4 
 
 
571 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.4 
 
 
571 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  32.61 
 
 
624 aa  245  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  33.2 
 
 
622 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  45.49 
 
 
606 aa  244  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  32.95 
 
 
768 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  31.22 
 
 
578 aa  244  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  31.17 
 
 
623 aa  244  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  32.7 
 
 
592 aa  244  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  32.25 
 
 
630 aa  244  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  31.43 
 
 
575 aa  244  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  31.06 
 
 
609 aa  244  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.88 
 
 
571 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  32.81 
 
 
612 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  33.27 
 
 
606 aa  244  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  32.08 
 
 
624 aa  244  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  41.93 
 
 
597 aa  243  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.77 
 
 
611 aa  243  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>