More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0739 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  100 
 
 		 624 aa  1245    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6403  response regulator receiver protein  56.73 
 
 		 936 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.452757  normal  0.164839 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  55.63 
 
 		 981 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  55.63 
 
 		 991 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5251  response regulator receiver protein  56.13 
 
 		 893 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0456799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1388  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 921 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5655  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 935 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6441  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 933 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6032  response regulator receiver protein  57.07 
 
 		 933 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340327  normal  0.371985 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5437  response regulator receiver protein  56.73 
 
 		 914 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.04493 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3174  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  58.16 
 
 		 988 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1994  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 965 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.310969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1304  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 988 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1392  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  58.16 
 
 		 988 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.659485  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3046  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  58.16 
 
 		 988 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2280  putative ABC transporter, ATP-binding protein  57.99 
 
 		 988 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1016  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 988 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4394  response regulator receiver protein  56.79 
 
 		 906 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0230097  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  51.04 
 
 		 593 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  53.42 
 
 		 606 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  51.91 
 
 		 592 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  52.14 
 
 		 629 aa  591  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  51.27 
 
 		 622 aa  585  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  51.77 
 
 		 605 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  51.52 
 
 		 630 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  52.78 
 
 		 621 aa  581  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  50.42 
 
 		 612 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  50.92 
 
 		 623 aa  582  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  50.76 
 
 		 623 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  50.76 
 
 		 623 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  50.25 
 
 		 612 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  49.16 
 
 		 607 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  51.02 
 
 		 651 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  50.92 
 
 		 623 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  48.76 
 
 		 625 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  49.92 
 
 		 623 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  48.79 
 
 		 607 aa  568  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0803  ABC transporter related  51.68 
 
 		 624 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.253517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  50.74 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.58 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  50.58 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  50.58 
 
 		 654 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  50.09 
 
 		 631 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  49.22 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  49.66 
 
 		 656 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  50.59 
 
 		 623 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  50.74 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  50.42 
 
 		 623 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  50.58 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  50.58 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  51.74 
 
 		 603 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  50.09 
 
 		 629 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  49.3 
 
 		 606 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  49.15 
 
 		 606 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  50.51 
 
 		 597 aa  555  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  49.66 
 
 		 603 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  49.75 
 
 		 621 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  48.8 
 
 		 646 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  50.52 
 
 		 608 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  51.78 
 
 		 615 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  48.96 
 
 		 596 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  48.96 
 
 		 631 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  48.96 
 
 		 596 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  48.63 
 
 		 589 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3906  ABC transporter related  49.57 
 
 		 619 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  50 
 
 		 603 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  49.38 
 
 		 590 aa  536  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  45.57 
 
 		 590 aa  535  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  49.12 
 
 		 612 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  46.1 
 
 		 591 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  46.89 
 
 		 591 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  49.12 
 
 		 612 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  48.4 
 
 		 598 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  48.29 
 
 		 617 aa  527  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  45.26 
 
 		 655 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4026  ABC transporter-related protein  49.76 
 
 		 619 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236263 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  45.41 
 
 		 652 aa  525  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  48.61 
 
 		 610 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  48.4 
 
 		 607 aa  523  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  46.09 
 
 		 590 aa  519  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  45.36 
 
 		 661 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  49.81 
 
 		 626 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2585  ABC transporter related  48.35 
 
 		 637 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.695823  decreased coverage  0.00374434 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3826  ABC transporter related  47.02 
 
 		 598 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.094291  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  45.19 
 
 		 651 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  47.02 
 
 		 598 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  47.36 
 
 		 598 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  47.02 
 
 		 598 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  46.85 
 
 		 598 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  44.41 
 
 		 672 aa  514  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  47.36 
 
 		 596 aa  512  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  44.85 
 
 		 672 aa  512  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  47.44 
 
 		 594 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  47.36 
 
 		 596 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  44.95 
 
 		 597 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.7 
 
 		 627 aa  515  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1701  ABC transporter related  44.43 
 
 		 598 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2616  ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 		 591 aa  510  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  45.78 
 
 		 640 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.5 
 
 		 602 aa  507  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>