More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4878 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1994  putative ABC transporter, ATP-binding protein  55.26 
 
 		 965 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.310969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3174  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  55.18 
 
 		 988 aa  670    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4394  response regulator receiver protein  54.85 
 
 		 906 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0230097  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  55.63 
 
 		 624 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1392  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  55.26 
 
 		 988 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.659485  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3046  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  55.18 
 
 		 988 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5437  response regulator receiver protein  45.6 
 
 		 914 aa  693    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.04493 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1304  putative ABC transporter, ATP-binding protein  55.26 
 
 		 988 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1016  putative ABC transporter, ATP-binding protein  55.26 
 
 		 988 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  100 
 
 		 991 aa  1972    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2280  putative ABC transporter, ATP-binding protein  55.11 
 
 		 988 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  99.9 
 
 		 981 aa  1951    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5251  response regulator receiver protein  46.89 
 
 		 893 aa  744    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0456799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1388  response regulator receiver protein  54.43 
 
 		 921 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6032  response regulator receiver protein  54.03 
 
 		 933 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340327  normal  0.371985 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5655  response regulator receiver protein  54.67 
 
 		 935 aa  685    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6441  response regulator receiver protein  53.89 
 
 		 933 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6403  response regulator receiver protein  54.37 
 
 		 936 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.452757  normal  0.164839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  54.01 
 
 		 608 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  52.45 
 
 		 606 aa  598  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  51.42 
 
 		 622 aa  592  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  50 
 
 		 612 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  51.32 
 
 		 629 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  49.83 
 
 		 612 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 592 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  51.3 
 
 		 593 aa  585  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  49.76 
 
 		 625 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  52.85 
 
 		 623 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  49.92 
 
 		 623 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  50.41 
 
 		 656 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  49.92 
 
 		 623 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  49.92 
 
 		 623 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  50.25 
 
 		 631 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  52.11 
 
 		 603 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  50 
 
 		 629 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  52.55 
 
 		 621 aa  569  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  50.41 
 
 		 623 aa  572  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  50.75 
 
 		 603 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  51.75 
 
 		 621 aa  569  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  51.47 
 
 		 623 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.95 
 
 		 651 aa  567  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  50.69 
 
 		 606 aa  566  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  52.11 
 
 		 603 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  51.3 
 
 		 623 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  49.17 
 
 		 605 aa  561  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  49.25 
 
 		 630 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  49.06 
 
 		 589 aa  561  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  49.75 
 
 		 623 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  49.11 
 
 		 654 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3906  ABC transporter related  51.38 
 
 		 619 aa  558  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  49.75 
 
 		 623 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  49.59 
 
 		 623 aa  556  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  49.59 
 
 		 623 aa  556  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  50.99 
 
 		 608 aa  554  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.59 
 
 		 623 aa  556  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  49.59 
 
 		 623 aa  556  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  50.52 
 
 		 606 aa  555  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  48.45 
 
 		 607 aa  551  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2585  ABC transporter related  51.73 
 
 		 637 aa  551  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.695823  decreased coverage  0.00374434 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  52.27 
 
 		 590 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0803  ABC transporter related  52.68 
 
 		 624 aa  549  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.253517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  51.13 
 
 		 597 aa  552  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4026  ABC transporter-related protein  51.88 
 
 		 619 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236263 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  48.11 
 
 		 607 aa  545  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  49.49 
 
 		 612 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  47.59 
 
 		 596 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  49 
 
 		 646 aa  538  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  47.59 
 
 		 596 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  49.41 
 
 		 612 aa  539  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  47.59 
 
 		 631 aa  536  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  48.25 
 
 		 617 aa  531  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  45.91 
 
 		 652 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  48.42 
 
 		 610 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  45.67 
 
 		 662 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  52.4 
 
 		 615 aa  522  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  45.74 
 
 		 661 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  45.44 
 
 		 663 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  47.37 
 
 		 640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  44.79 
 
 		 655 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  44.97 
 
 		 651 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  48.01 
 
 		 611 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  47.26 
 
 		 606 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  44.93 
 
 		 628 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  45.1 
 
 		 655 aa  515  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  48.78 
 
 		 624 aa  513  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  45.05 
 
 		 672 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  46.05 
 
 		 591 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  45.58 
 
 		 647 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.4 
 
 		 627 aa  511  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2616  ABC transporter ATP-binding protein  47.7 
 
 		 591 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.53 
 
 		 602 aa  506  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  47.74 
 
 		 595 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  45.39 
 
 		 626 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  45.38 
 
 		 590 aa  504  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  47.94 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  44.66 
 
 		 591 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  45.44 
 
 		 598 aa  502  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  45.45 
 
 		 594 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  45.45 
 
 		 596 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  45.45 
 
 		 598 aa  502  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>