More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4394 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A3174  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  62.52 
 
 		 988 aa  847    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3046  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  62.52 
 
 		 988 aa  847    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1994  putative ABC transporter, ATP-binding protein  62.52 
 
 		 965 aa  846    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.310969  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4394  response regulator receiver protein  100 
 
 		 906 aa  1815    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0230097  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  56.38 
 
 		 624 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1392  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  62.52 
 
 		 988 aa  846    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.659485  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5437  response regulator receiver protein  57.86 
 
 		 914 aa  956    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.04493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5251  response regulator receiver protein  52.97 
 
 		 893 aa  870    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0456799 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  54.85 
 
 		 981 aa  728    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  54.85 
 
 		 991 aa  727    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1304  putative ABC transporter, ATP-binding protein  62.52 
 
 		 988 aa  846    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6403  response regulator receiver protein  58.66 
 
 		 936 aa  947    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.452757  normal  0.164839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1388  response regulator receiver protein  56.57 
 
 		 921 aa  934    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2280  putative ABC transporter, ATP-binding protein  62.38 
 
 		 988 aa  845    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6032  response regulator receiver protein  56.35 
 
 		 933 aa  929    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340327  normal  0.371985 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5655  response regulator receiver protein  58.31 
 
 		 935 aa  943    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6441  response regulator receiver protein  56.57 
 
 		 933 aa  935    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1016  putative ABC transporter, ATP-binding protein  62.52 
 
 		 988 aa  846    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  49.49 
 
 		 606 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 593 aa  565  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  49.66 
 
 		 622 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  49.83 
 
 		 651 aa  562  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  48.63 
 
 		 623 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 		 592 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  49.91 
 
 		 654 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  48.63 
 
 		 623 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  48.63 
 
 		 623 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  47.37 
 
 		 612 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  47.71 
 
 		 612 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  49.49 
 
 		 623 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  49.91 
 
 		 623 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  47.84 
 
 		 603 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  48.85 
 
 		 656 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  49.91 
 
 		 623 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.91 
 
 		 623 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  49.91 
 
 		 623 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  49.49 
 
 		 623 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  48.37 
 
 		 629 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0803  ABC transporter related  50.17 
 
 		 624 aa  544  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.253517  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  46.1 
 
 		 607 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  48.63 
 
 		 623 aa  545  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  48.72 
 
 		 623 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  46.77 
 
 		 607 aa  544  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  48.46 
 
 		 623 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  48.63 
 
 		 623 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  48.46 
 
 		 631 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  48.59 
 
 		 603 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  47.13 
 
 		 606 aa  540  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  47.72 
 
 		 605 aa  538  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  47.16 
 
 		 629 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  47.64 
 
 		 606 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  44.88 
 
 		 608 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  48.06 
 
 		 597 aa  531  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  48.09 
 
 		 603 aa  531  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  48.12 
 
 		 621 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  47.5 
 
 		 630 aa  524  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  47.37 
 
 		 646 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.87 
 
 		 628 aa  521  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  45.37 
 
 		 655 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.7 
 
 		 625 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.5 
 
 		 627 aa  520  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4026  ABC transporter-related protein  47.34 
 
 		 619 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  44.88 
 
 		 651 aa  519  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  45.54 
 
 		 652 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  45.02 
 
 		 625 aa  519  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  44.05 
 
 		 591 aa  510  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  45.57 
 
 		 612 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  44.21 
 
 		 628 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  45.74 
 
 		 612 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  44.75 
 
 		 655 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  48.68 
 
 		 590 aa  512  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  46.29 
 
 		 610 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  45.53 
 
 		 598 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  43.89 
 
 		 661 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  44.92 
 
 		 590 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  45.42 
 
 		 598 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2616  ABC transporter ATP-binding protein  46.13 
 
 		 591 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  45.69 
 
 		 595 aa  508  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  44.57 
 
 		 631 aa  505  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  45.28 
 
 		 663 aa  505  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  44.57 
 
 		 596 aa  505  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3826  ABC transporter related  45.42 
 
 		 598 aa  505  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.094291  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  45.2 
 
 		 657 aa  505  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  44.57 
 
 		 596 aa  505  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  45.25 
 
 		 598 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  45.42 
 
 		 598 aa  505  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  48.54 
 
 		 615 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  48.18 
 
 		 606 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  48.03 
 
 		 608 aa  505  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  45.35 
 
 		 594 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  45.35 
 
 		 596 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  43.21 
 
 		 625 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  44.81 
 
 		 662 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 		 589 aa  505  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  45.52 
 
 		 598 aa  506  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  43.61 
 
 		 590 aa  505  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  44.22 
 
 		 591 aa  505  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  43.73 
 
 		 625 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  45.61 
 
 		 640 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  43.91 
 
 		 672 aa  501  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>