More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1273 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  54.04 
 
 		 591 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  56.85 
 
 		 606 aa  672    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  57.45 
 
 		 607 aa  708    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  60.45 
 
 		 592 aa  720    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  60.51 
 
 		 608 aa  697    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  57.57 
 
 		 623 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  59.02 
 
 		 615 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  59.23 
 
 		 612 aa  730    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  53.26 
 
 		 590 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  56.81 
 
 		 623 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  56.98 
 
 		 623 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  59.09 
 
 		 629 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  59.07 
 
 		 623 aa  706    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  56.86 
 
 		 623 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  55.56 
 
 		 646 aa  636    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  58.27 
 
 		 625 aa  708    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  60.31 
 
 		 603 aa  692    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  60.71 
 
 		 605 aa  725    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  57.45 
 
 		 629 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  56.81 
 
 		 607 aa  693    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  100 
 
 		 622 aa  1252    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  55.44 
 
 		 591 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  56.98 
 
 		 654 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  59.56 
 
 		 612 aa  732    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  56.98 
 
 		 623 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  56.86 
 
 		 623 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  55.57 
 
 		 589 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  62.44 
 
 		 606 aa  731    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  54.53 
 
 		 617 aa  656    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  55.78 
 
 		 651 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0803  ABC transporter related  61.66 
 
 		 624 aa  683    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.253517  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  62.39 
 
 		 608 aa  720    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3906  ABC transporter related  60 
 
 		 619 aa  684    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  56.58 
 
 		 631 aa  683    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  59.42 
 
 		 656 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  57.89 
 
 		 630 aa  707    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  65.99 
 
 		 593 aa  814    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  56.86 
 
 		 623 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1701  ABC transporter related  55.15 
 
 		 598 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  53.94 
 
 		 594 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  53.94 
 
 		 596 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  56.6 
 
 		 606 aa  651    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4026  ABC transporter-related protein  58.57 
 
 		 619 aa  661    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  57.4 
 
 		 623 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  56.86 
 
 		 623 aa  700    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  56.81 
 
 		 623 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  53.94 
 
 		 598 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  57.17 
 
 		 603 aa  682    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  56.98 
 
 		 623 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  59.17 
 
 		 597 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  60.21 
 
 		 590 aa  669    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  59.87 
 
 		 621 aa  695    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  60.31 
 
 		 603 aa  680    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  56.98 
 
 		 623 aa  675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2585  ABC transporter related  57.63 
 
 		 637 aa  653    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.695823  decreased coverage  0.00374434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  61.01 
 
 		 621 aa  703    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  53.44 
 
 		 590 aa  634  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  55.09 
 
 		 598 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  53.73 
 
 		 596 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  53.73 
 
 		 631 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  53.77 
 
 		 596 aa  628  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  54.37 
 
 		 598 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  53.73 
 
 		 596 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3826  ABC transporter related  54.37 
 
 		 598 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.094291  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  51.72 
 
 		 602 aa  624  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  54.2 
 
 		 598 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  54.02 
 
 		 598 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  55.65 
 
 		 595 aa  623  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  53.06 
 
 		 612 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  53.06 
 
 		 612 aa  621  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  53.57 
 
 		 607 aa  619  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  52.13 
 
 		 655 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  50.6 
 
 		 597 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2616  ABC transporter ATP-binding protein  52.9 
 
 		 591 aa  614  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  52.05 
 
 		 652 aa  610  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  50.65 
 
 		 655 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  51.88 
 
 		 661 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0659  ABC transporter, ATP-binding protein  54.28 
 
 		 594 aa  610  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000175742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  53.15 
 
 		 651 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  52.67 
 
 		 610 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  52.09 
 
 		 672 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  51.31 
 
 		 640 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  51.29 
 
 		 651 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  49.84 
 
 		 672 aa  605  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 		 577 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  50.55 
 
 		 662 aa  600  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  53.08 
 
 		 644 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  50.47 
 
 		 663 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  52.82 
 
 		 647 aa  601  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  50.85 
 
 		 627 aa  601  1e-170  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3300  ABC transporter related  52.06 
 
 		 609 aa  595  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0999456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  52.75 
 
 		 654 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  51.6 
 
 		 981 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  50.49 
 
 		 657 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  51.67 
 
 		 652 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  51.42 
 
 		 991 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2899  ABC transporter related  50 
 
 		 601 aa  591  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0186152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.41 
 
 		 628 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  51.67 
 
 		 611 aa  586  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  51.71 
 
 		 624 aa  583  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>