More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3493 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  59.28 
 
 		 593 aa  760    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  54.5 
 
 		 646 aa  671    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  54.06 
 
 		 596 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  54.06 
 
 		 631 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  69.31 
 
 		 592 aa  850    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  76.05 
 
 		 608 aa  904    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  64.47 
 
 		 623 aa  789    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  68.3 
 
 		 612 aa  862    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  74.8 
 
 		 625 aa  939    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  64.31 
 
 		 623 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  55.09 
 
 		 589 aa  659    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  64.47 
 
 		 623 aa  789    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  63.65 
 
 		 607 aa  803    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  65.62 
 
 		 607 aa  823    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 603 aa  666    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  64.47 
 
 		 623 aa  789    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  54.06 
 
 		 596 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  61.74 
 
 		 605 aa  739    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  67.65 
 
 		 629 aa  843    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  56.31 
 
 		 615 aa  650    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  61.91 
 
 		 622 aa  753    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  64.47 
 
 		 654 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  64.5 
 
 		 623 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  74.02 
 
 		 603 aa  861    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  53.03 
 
 		 612 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  53.79 
 
 		 606 aa  650    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  64.91 
 
 		 623 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  65.35 
 
 		 631 aa  804    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  61.26 
 
 		 606 aa  724    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  54.12 
 
 		 617 aa  644    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  64.09 
 
 		 651 aa  797    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  64.64 
 
 		 629 aa  804    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  52.86 
 
 		 612 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  100 
 
 		 608 aa  1242    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  64.58 
 
 		 623 aa  810    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3906  ABC transporter related  81.34 
 
 		 619 aa  956    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4026  ABC transporter-related protein  71.57 
 
 		 619 aa  823    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  64.97 
 
 		 656 aa  806    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2585  ABC transporter related  73.31 
 
 		 637 aa  848    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.695823  decreased coverage  0.00374434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  77.36 
 
 		 621 aa  909    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  66.89 
 
 		 630 aa  831    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0803  ABC transporter related  65.59 
 
 		 624 aa  733    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.253517  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  64.58 
 
 		 623 aa  809    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  64.47 
 
 		 623 aa  789    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  68.3 
 
 		 612 aa  861    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  64.31 
 
 		 623 aa  788    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  54.2 
 
 		 606 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  64.33 
 
 		 623 aa  796    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  64.58 
 
 		 623 aa  809    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  73.68 
 
 		 603 aa  875    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  65.67 
 
 		 623 aa  805    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  54.5 
 
 		 597 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  71.94 
 
 		 590 aa  843    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  83.61 
 
 		 621 aa  973    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  51.51 
 
 		 602 aa  632  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  51.38 
 
 		 652 aa  627  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  52.38 
 
 		 991 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  52.84 
 
 		 981 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  52.1 
 
 		 651 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  53.53 
 
 		 607 aa  623  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  52.92 
 
 		 595 aa  623  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  52.27 
 
 		 672 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1701  ABC transporter related  52.33 
 
 		 598 aa  620  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  52.85 
 
 		 591 aa  617  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  50.57 
 
 		 655 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  51.32 
 
 		 672 aa  614  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  51.92 
 
 		 610 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  50.89 
 
 		 624 aa  613  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  50.57 
 
 		 661 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  51.32 
 
 		 640 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  50.74 
 
 		 655 aa  611  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  51.81 
 
 		 591 aa  609  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  52.16 
 
 		 598 aa  611  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  51.37 
 
 		 598 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3300  ABC transporter related  50.58 
 
 		 609 aa  605  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0999456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  50.95 
 
 		 590 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  51.64 
 
 		 594 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  50.5 
 
 		 606 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  50.92 
 
 		 626 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  51.47 
 
 		 596 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  50.92 
 
 		 644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  50.94 
 
 		 647 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3826  ABC transporter related  51.72 
 
 		 598 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.094291  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  51.12 
 
 		 596 aa  601  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  50.16 
 
 		 662 aa  600  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  51.72 
 
 		 598 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  49.92 
 
 		 663 aa  598  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  51.87 
 
 		 611 aa  600  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.59 
 
 		 628 aa  601  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  51.55 
 
 		 598 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  51.01 
 
 		 652 aa  601  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  51.72 
 
 		 598 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2616  ABC transporter ATP-binding protein  50.09 
 
 		 591 aa  598  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  51.31 
 
 		 577 aa  599  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  50.68 
 
 		 657 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  50.09 
 
 		 590 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  48.54 
 
 		 597 aa  594  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  51.01 
 
 		 654 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  49.51 
 
 		 651 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1912  ABC transporter related  50.84 
 
 		 604 aa  588  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>