More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6875 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  58.28 
 
 		 635 aa  645    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  60.74 
 
 		 607 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  60.24 
 
 		 613 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  66.84 
 
 		 594 aa  735    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  62.78 
 
 		 589 aa  687    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1170    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.79 
 
 		 613 aa  595  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.03 
 
 		 626 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3782  hypothetical protein  53.94 
 
 		 593 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.245916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  50.17 
 
 		 623 aa  561  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  43.12 
 
 		 628 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  40.38 
 
 		 611 aa  428  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 632 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  43.44 
 
 		 658 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.21 
 
 		 671 aa  418  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  40.6 
 
 		 636 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  42.01 
 
 		 642 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  38 
 
 		 648 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.96 
 
 		 634 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  41.44 
 
 		 622 aa  412  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  40.85 
 
 		 648 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  43.12 
 
 		 658 aa  412  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  41.24 
 
 		 624 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 632 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 635 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  40.61 
 
 		 641 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  39.39 
 
 		 638 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  39.5 
 
 		 642 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.17 
 
 		 622 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  39.58 
 
 		 598 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  40.31 
 
 		 627 aa  392  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.44 
 
 		 614 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  40.37 
 
 		 624 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 628 aa  392  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  39 
 
 		 687 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  38.42 
 
 		 640 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 598 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  39.07 
 
 		 626 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  39.23 
 
 		 639 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  38.55 
 
 		 622 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  40.48 
 
 		 626 aa  372  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  43.24 
 
 		 620 aa  372  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  38.67 
 
 		 627 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  38.67 
 
 		 627 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  40.48 
 
 		 640 aa  372  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  38.57 
 
 		 659 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  39.46 
 
 		 637 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  39.33 
 
 		 638 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  39.17 
 
 		 648 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  39.22 
 
 		 654 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  38.66 
 
 		 611 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  33.22 
 
 		 582 aa  365  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  38.15 
 
 		 611 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  37.06 
 
 		 582 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  38.47 
 
 		 627 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  38.16 
 
 		 587 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  38.37 
 
 		 637 aa  363  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  38.47 
 
 		 663 aa  363  6e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  37.35 
 
 		 631 aa  362  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  37.56 
 
 		 638 aa  357  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.2 
 
 		 584 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  39.25 
 
 		 631 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.07 
 
 		 556 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.62 
 
 		 597 aa  355  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.82 
 
 		 611 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3591  hypothetical protein  40.61 
 
 		 588 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0726978  normal  0.99398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  36.08 
 
 		 614 aa  352  8e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.26 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  34.81 
 
 		 584 aa  352  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.06 
 
 		 627 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 632 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  36.05 
 
 		 584 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.57 
 
 		 601 aa  350  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.91 
 
 		 586 aa  349  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.28 
 
 		 586 aa  349  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.09 
 
 		 586 aa  349  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.33 
 
 		 608 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.74 
 
 		 580 aa  348  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  35.02 
 
 		 579 aa  348  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  37.1 
 
 		 611 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.74 
 
 		 586 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.91 
 
 		 586 aa  347  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.91 
 
 		 586 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  33.05 
 
 		 586 aa  346  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33.74 
 
 		 586 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.74 
 
 		 586 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  33.51 
 
 		 580 aa  345  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33 
 
 		 596 aa  343  7e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.38 
 
 		 601 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.61 
 
 		 580 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.89 
 
 		 578 aa  342  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.89 
 
 		 578 aa  342  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.4 
 
 		 602 aa  340  4e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.98 
 
 		 579 aa  340  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  32.69 
 
 		 572 aa  340  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  32.69 
 
 		 572 aa  340  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  35.59 
 
 		 606 aa  339  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.63 
 
 		 572 aa  339  9e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  35.89 
 
 		 597 aa  339  9e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  32.71 
 
 		 586 aa  339  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>