More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2209 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  61.89 
 
 		 635 aa  669    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  60.35 
 
 		 640 aa  726    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  60.27 
 
 		 648 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  65.74 
 
 		 636 aa  767    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  60.27 
 
 		 631 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  59.87 
 
 		 627 aa  695    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  62.4 
 
 		 639 aa  707    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  64.6 
 
 		 632 aa  719    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  63.3 
 
 		 642 aa  746    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  64.76 
 
 		 634 aa  757    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  59.51 
 
 		 638 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  64.6 
 
 		 632 aa  770    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  59.46 
 
 		 638 aa  689    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  67.36 
 
 		 642 aa  785    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  80.61 
 
 		 641 aa  965    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  57.23 
 
 		 638 aa  647    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  64.98 
 
 		 624 aa  741    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  56.73 
 
 		 637 aa  635    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  58.88 
 
 		 627 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  59.45 
 
 		 622 aa  684    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  56.96 
 
 		 637 aa  649    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 628 aa  673    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  68.37 
 
 		 648 aa  791    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  59.16 
 
 		 631 aa  662    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  60.65 
 
 		 658 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  58.52 
 
 		 627 aa  654    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  60.58 
 
 		 627 aa  676    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  58.88 
 
 		 627 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  59.13 
 
 		 622 aa  699    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  100 
 
 		 687 aa  1347    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  56.79 
 
 		 654 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  55.77 
 
 		 622 aa  650    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  59.49 
 
 		 626 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  59.61 
 
 		 624 aa  639    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  59.97 
 
 		 658 aa  701    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  56.57 
 
 		 640 aa  635  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  57.75 
 
 		 659 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  56.86 
 
 		 620 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  58.24 
 
 		 632 aa  615  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  58.42 
 
 		 663 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.75 
 
 		 614 aa  610  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  42.88 
 
 		 648 aa  497  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  45.31 
 
 		 628 aa  490  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  44.98 
 
 		 626 aa  486  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 623 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.6 
 
 		 671 aa  413  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  41.65 
 
 		 594 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  39 
 
 		 593 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.89 
 
 		 586 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.55 
 
 		 586 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  34.39 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.39 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.06 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  34.22 
 
 		 586 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 586 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  38.04 
 
 		 635 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 		 586 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  37.85 
 
 		 589 aa  363  6e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.34 
 
 		 626 aa  363  7.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.44 
 
 		 613 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  35.09 
 
 		 611 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.71 
 
 		 597 aa  355  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.71 
 
 		 597 aa  355  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.11 
 
 		 617 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.85 
 
 		 608 aa  351  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.28 
 
 		 586 aa  351  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  37.44 
 
 		 607 aa  350  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  39.46 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  39.59 
 
 		 613 aa  347  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.11 
 
 		 602 aa  343  5.999999999999999e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33 
 
 		 579 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  36.04 
 
 		 592 aa  340  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.94 
 
 		 614 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.97 
 
 		 585 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.11 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  33.76 
 
 		 635 aa  333  5e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  34.74 
 
 		 617 aa  333  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  32.03 
 
 		 598 aa  332  2e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.61 
 
 		 583 aa  331  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.25 
 
 		 597 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  33.66 
 
 		 640 aa  328  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  32.74 
 
 		 631 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 600 aa  326  9e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  32.94 
 
 		 584 aa  326  9e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.45 
 
 		 571 aa  326  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.45 
 
 		 571 aa  326  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.45 
 
 		 571 aa  326  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.91 
 
 		 606 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  31.84 
 
 		 598 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  30.7 
 
 		 594 aa  324  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  32.34 
 
 		 663 aa  324  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.28 
 
 		 571 aa  324  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.28 
 
 		 571 aa  324  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.28 
 
 		 571 aa  323  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 607 aa  323  9.000000000000001e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  33.61 
 
 		 600 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.28 
 
 		 571 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  35.2 
 
 		 598 aa  322  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>