More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1676 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  58.31 
 
 
622 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  57.42 
 
 
638 aa  656    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  57.77 
 
 
631 aa  646    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  60.42 
 
 
627 aa  716    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  59.05 
 
 
622 aa  693    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  59.75 
 
 
639 aa  685    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  59.51 
 
 
631 aa  671    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  59.03 
 
 
624 aa  653    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  100 
 
 
641 aa  1266    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  58.08 
 
 
638 aa  659    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  63.88 
 
 
642 aa  758    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  59.6 
 
 
648 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  60.59 
 
 
658 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  60.35 
 
 
640 aa  725    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  58.88 
 
 
627 aa  667    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  64.14 
 
 
634 aa  751    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  58.74 
 
 
627 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  59 
 
 
628 aa  674    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  55.02 
 
 
637 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  65.65 
 
 
636 aa  778    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  61.99 
 
 
635 aa  669    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  68.93 
 
 
648 aa  812    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  55.21 
 
 
622 aa  647    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  64.67 
 
 
632 aa  780    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  60.83 
 
 
627 aa  698    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  58.88 
 
 
627 aa  667    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  80.61 
 
 
687 aa  979    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  58.81 
 
 
626 aa  670    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  65.15 
 
 
632 aa  734    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  66.02 
 
 
642 aa  769    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  61.14 
 
 
658 aa  699    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  64.62 
 
 
624 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  59.48 
 
 
638 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  56.35 
 
 
654 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  56.83 
 
 
659 aa  635  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  56.42 
 
 
640 aa  634  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  55.52 
 
 
620 aa  629  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  58.05 
 
 
632 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  57.67 
 
 
663 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  55.43 
 
 
637 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.43 
 
 
614 aa  605  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  44.39 
 
 
648 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  45.43 
 
 
626 aa  500  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  44.1 
 
 
628 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
594 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  40.96 
 
 
623 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.38 
 
 
671 aa  416  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  40.61 
 
 
593 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  40.39 
 
 
635 aa  398  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  39.46 
 
 
607 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.42 
 
 
613 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  36.05 
 
 
611 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  39.52 
 
 
589 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.28 
 
 
586 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.49 
 
 
577 aa  363  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33 
 
 
586 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33 
 
 
586 aa  362  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33 
 
 
586 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.66 
 
 
586 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33 
 
 
586 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33 
 
 
586 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.66 
 
 
586 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.15 
 
 
586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.46 
 
 
626 aa  357  5e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.06 
 
 
602 aa  356  5.999999999999999e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.55 
 
 
571 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  33.11 
 
 
586 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  40.82 
 
 
613 aa  355  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  37.02 
 
 
608 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.45 
 
 
579 aa  352  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.04 
 
 
571 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.37 
 
 
597 aa  351  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.87 
 
 
571 aa  350  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.87 
 
 
571 aa  350  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.87 
 
 
571 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.87 
 
 
571 aa  350  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.04 
 
 
571 aa  349  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.72 
 
 
597 aa  349  9e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.72 
 
 
597 aa  349  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
598 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.7 
 
 
571 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  37.63 
 
 
601 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.7 
 
 
571 aa  347  5e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  36.64 
 
 
597 aa  347  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.7 
 
 
571 aa  347  5e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  33.39 
 
 
598 aa  347  5e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.58 
 
 
585 aa  346  6e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.85 
 
 
601 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.76 
 
 
578 aa  344  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.73 
 
 
614 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.76 
 
 
578 aa  344  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.29 
 
 
607 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.64 
 
 
606 aa  343  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  33.33 
 
 
635 aa  342  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.6 
 
 
578 aa  342  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.89 
 
 
617 aa  340  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  31.89 
 
 
586 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  35.36 
 
 
607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  36.89 
 
 
592 aa  336  5.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  32.77 
 
 
584 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>