More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2565 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  60.58 
 
 		 687 aa  710    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  59.42 
 
 		 658 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  59.13 
 
 		 627 aa  684    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 632 aa  697    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  59.67 
 
 		 622 aa  672    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  60.71 
 
 		 642 aa  699    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  60.83 
 
 		 641 aa  726    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  58.59 
 
 		 634 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  60.16 
 
 		 622 aa  696    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  55.61 
 
 		 627 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  62.4 
 
 		 642 aa  717    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  57.24 
 
 		 640 aa  678    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  61.65 
 
 		 648 aa  693    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  60.68 
 
 		 624 aa  704    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  100 
 
 		 627 aa  1226    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  55.61 
 
 		 627 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  64.9 
 
 		 638 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  60.19 
 
 		 636 aa  720    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  56.03 
 
 		 626 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  60.65 
 
 		 639 aa  669    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  58.78 
 
 		 658 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  57.95 
 
 		 638 aa  656    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  56.77 
 
 		 628 aa  634  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  57.33 
 
 		 632 aa  633  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  57.72 
 
 		 627 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  57.24 
 
 		 638 aa  621  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  55.93 
 
 		 640 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  54.23 
 
 		 631 aa  609  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  54.93 
 
 		 659 aa  611  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  56.15 
 
 		 663 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  56.97 
 
 		 620 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  58.82 
 
 		 648 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  55.24 
 
 		 622 aa  603  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  57.12 
 
 		 635 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  54.94 
 
 		 631 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  53.99 
 
 		 637 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  54.38 
 
 		 654 aa  594  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.88 
 
 		 614 aa  589  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  52.97 
 
 		 637 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  54.8 
 
 		 624 aa  586  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  56.64 
 
 		 632 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  47.77 
 
 		 648 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  47.6 
 
 		 628 aa  511  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  45.83 
 
 		 626 aa  498  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 623 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  42.25 
 
 		 594 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  38.47 
 
 		 593 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.42 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  40.24 
 
 		 635 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.17 
 
 		 613 aa  385  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.73 
 
 		 626 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  40.1 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  40.87 
 
 		 589 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 613 aa  365  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  36.17 
 
 		 611 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.77 
 
 		 598 aa  364  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.52 
 
 		 608 aa  364  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  34.11 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.56 
 
 		 586 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 		 586 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.28 
 
 		 586 aa  355  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  39.24 
 
 		 614 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.45 
 
 		 586 aa  353  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.56 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.56 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  34.56 
 
 		 586 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.56 
 
 		 586 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38.01 
 
 		 606 aa  351  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.11 
 
 		 586 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.06 
 
 		 577 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.16 
 
 		 601 aa  345  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.61 
 
 		 601 aa  343  7e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  35.62 
 
 		 597 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.89 
 
 		 571 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.89 
 
 		 571 aa  340  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.89 
 
 		 571 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.89 
 
 		 571 aa  340  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.89 
 
 		 571 aa  340  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.89 
 
 		 571 aa  340  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.89 
 
 		 571 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 		 571 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.73 
 
 		 571 aa  337  5e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.73 
 
 		 571 aa  336  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.61 
 
 		 586 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 629 aa  334  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  34.28 
 
 		 600 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  36.59 
 
 		 660 aa  332  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.94 
 
 		 578 aa  330  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.94 
 
 		 578 aa  330  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.83 
 
 		 597 aa  330  7e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3782  hypothetical protein  36.26 
 
 		 593 aa  330  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.245916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.67 
 
 		 597 aa  330  7e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  36.48 
 
 		 641 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.33 
 
 		 602 aa  327  6e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.61 
 
 		 597 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.35 
 
 		 582 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1595  ABC transporter related  38.41 
 
 		 670 aa  325  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.12327  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.35 
 
 		 582 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.35 
 
 		 582 aa  325  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.79 
 
 		 587 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>