More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0777 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  66.15 
 
 
613 aa  713    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  58.28 
 
 
593 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  100 
 
 
635 aa  1234    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  75.81 
 
 
613 aa  803    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  57.47 
 
 
594 aa  628  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  56.03 
 
 
607 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  55.63 
 
 
589 aa  557  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  52.97 
 
 
626 aa  555  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  47.43 
 
 
623 aa  515  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3782  hypothetical protein  50.34 
 
 
593 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.245916  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  41.88 
 
 
628 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.91 
 
 
634 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  40.16 
 
 
638 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  42.32 
 
 
632 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  43.62 
 
 
635 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  38.4 
 
 
648 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  41.9 
 
 
624 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  41.8 
 
 
639 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  40.39 
 
 
641 aa  395  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  39.71 
 
 
636 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  40.13 
 
 
632 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
622 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  38.21 
 
 
611 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  40.07 
 
 
627 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.68 
 
 
671 aa  382  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  41.11 
 
 
658 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  38.87 
 
 
642 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  39.31 
 
 
642 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.26 
 
 
614 aa  375  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  41.28 
 
 
658 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.4 
 
 
622 aa  372  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  38.1 
 
 
687 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  39.1 
 
 
648 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.31 
 
 
598 aa  362  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  39.31 
 
 
640 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  39.26 
 
 
648 aa  361  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  39.93 
 
 
620 aa  360  6e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  40.23 
 
 
624 aa  359  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  40.24 
 
 
627 aa  356  6.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  38.33 
 
 
622 aa  356  8.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  39.64 
 
 
640 aa  355  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  38.87 
 
 
628 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  37.36 
 
 
638 aa  347  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.61 
 
 
598 aa  347  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  38.26 
 
 
659 aa  346  7e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 
598 aa  346  1e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  38.2 
 
 
638 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  38.59 
 
 
663 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  39.04 
 
 
626 aa  343  7e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.17 
 
 
602 aa  343  7e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  36.86 
 
 
637 aa  339  9e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  38.97 
 
 
632 aa  337  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  37.74 
 
 
567 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.57 
 
 
567 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  38.33 
 
 
654 aa  335  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  35.97 
 
 
631 aa  334  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.23 
 
 
627 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  36.19 
 
 
626 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.73 
 
 
584 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  38.18 
 
 
637 aa  330  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.53 
 
 
614 aa  324  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  35.79 
 
 
627 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  35.79 
 
 
627 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.55 
 
 
567 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.22 
 
 
617 aa  323  5e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.7 
 
 
586 aa  323  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.28 
 
 
577 aa  323  8e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.08 
 
 
584 aa  322  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  37.77 
 
 
631 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.99 
 
 
578 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.99 
 
 
578 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  35.34 
 
 
587 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.26 
 
 
597 aa  320  5e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3591  hypothetical protein  38.9 
 
 
588 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0726978  normal  0.99398 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  31.85 
 
 
592 aa  320  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.26 
 
 
597 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  29.74 
 
 
597 aa  319  7.999999999999999e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  30.94 
 
 
598 aa  319  9e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.71 
 
 
586 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  37.48 
 
 
608 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  32.06 
 
 
586 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.53 
 
 
586 aa  317  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.53 
 
 
586 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.18 
 
 
586 aa  317  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.53 
 
 
586 aa  317  6e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.53 
 
 
586 aa  317  6e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  30.33 
 
 
582 aa  316  8e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  34.06 
 
 
587 aa  316  9e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.36 
 
 
586 aa  316  9e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.32 
 
 
571 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.86 
 
 
571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.86 
 
 
571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  34.78 
 
 
568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.86 
 
 
571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  37.56 
 
 
601 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.86 
 
 
571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.86 
 
 
571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  36.16 
 
 
636 aa  315  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.86 
 
 
571 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.75 
 
 
597 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>