More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2075 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  66.12 
 
 
640 aa  779    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  63.09 
 
 
628 aa  721    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  61.45 
 
 
631 aa  684    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  58.17 
 
 
627 aa  677    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  62.25 
 
 
637 aa  699    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  63.8 
 
 
632 aa  663    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  66.13 
 
 
642 aa  754    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  71.27 
 
 
642 aa  852    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  63.29 
 
 
636 aa  747    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  64.98 
 
 
641 aa  766    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  57.44 
 
 
638 aa  646    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  63.28 
 
 
638 aa  728    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  62.31 
 
 
640 aa  703    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  61.95 
 
 
627 aa  707    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  64.21 
 
 
627 aa  712    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  64.1 
 
 
624 aa  720    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  59.22 
 
 
622 aa  682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  61.49 
 
 
637 aa  704    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  64.6 
 
 
687 aa  770    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  63.55 
 
 
638 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  59.19 
 
 
639 aa  652    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  66.56 
 
 
648 aa  752    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  60.69 
 
 
632 aa  664    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  100 
 
 
632 aa  1239    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.87 
 
 
614 aa  659    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  60.42 
 
 
627 aa  662    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  61.95 
 
 
627 aa  707    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  60.51 
 
 
663 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  66.5 
 
 
622 aa  768    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  61.98 
 
 
626 aa  713    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  60.73 
 
 
659 aa  668    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  61.1 
 
 
654 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  69.26 
 
 
658 aa  796    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  60.1 
 
 
622 aa  694    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  59.05 
 
 
634 aa  683    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  65.71 
 
 
648 aa  706    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  69.85 
 
 
658 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  61.12 
 
 
620 aa  672    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  57.62 
 
 
635 aa  634  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  56.26 
 
 
631 aa  625  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  56.24 
 
 
624 aa  608  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  45.1 
 
 
648 aa  521  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  44.57 
 
 
626 aa  491  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  45.13 
 
 
628 aa  490  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.04 
 
 
671 aa  434  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  42.69 
 
 
623 aa  428  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  40.76 
 
 
593 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  41.15 
 
 
594 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  40.13 
 
 
635 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
598 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.76 
 
 
613 aa  378  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  38.7 
 
 
611 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  41.05 
 
 
601 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
613 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  40.43 
 
 
589 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35 
 
 
586 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.67 
 
 
586 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.5 
 
 
586 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.23 
 
 
586 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  35.07 
 
 
586 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.17 
 
 
586 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.07 
 
 
586 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  35.33 
 
 
586 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.17 
 
 
586 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.83 
 
 
586 aa  365  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  40.24 
 
 
607 aa  363  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.08 
 
 
577 aa  360  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.28 
 
 
571 aa  359  9e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.28 
 
 
571 aa  359  9e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.28 
 
 
571 aa  359  9e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.28 
 
 
571 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.94 
 
 
571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.94 
 
 
571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  33.5 
 
 
571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.28 
 
 
571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.28 
 
 
571 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.07 
 
 
626 aa  356  5.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.11 
 
 
571 aa  356  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.28 
 
 
597 aa  351  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.28 
 
 
597 aa  352  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.23 
 
 
586 aa  350  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33 
 
 
597 aa  349  8e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.22 
 
 
578 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  37.56 
 
 
608 aa  348  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.22 
 
 
578 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  35.51 
 
 
617 aa  346  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1666  ABC transporter related  39.35 
 
 
665 aa  344  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.54 
 
 
614 aa  343  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.5 
 
 
578 aa  342  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.19 
 
 
598 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.1 
 
 
585 aa  342  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.78 
 
 
617 aa  342  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.17 
 
 
575 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.61 
 
 
579 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  35.79 
 
 
598 aa  333  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  32.52 
 
 
631 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.17 
 
 
598 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  32.66 
 
 
593 aa  332  2e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.28 
 
 
609 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  36.11 
 
 
600 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>