More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1231 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  64.65 
 
 		 634 aa  816    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  53.59 
 
 		 627 aa  636    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  100 
 
 		 631 aa  1263    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  56.26 
 
 		 632 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  53.45 
 
 		 622 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  59.39 
 
 		 641 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  55.26 
 
 		 640 aa  652    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  63.47 
 
 		 632 aa  746    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  58.08 
 
 		 642 aa  699    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  55.56 
 
 		 638 aa  663    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  63.8 
 
 		 635 aa  733    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  58.56 
 
 		 648 aa  682    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  59.16 
 
 		 687 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  55.86 
 
 		 624 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  54.46 
 
 		 642 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.52 
 
 		 622 aa  641    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  56.01 
 
 		 658 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  55.93 
 
 		 636 aa  665    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  55.68 
 
 		 658 aa  641    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  60.26 
 
 		 624 aa  697    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  54.29 
 
 		 627 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  53.26 
 
 		 622 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  52.44 
 
 		 626 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  52.32 
 
 		 639 aa  598  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  52.18 
 
 		 627 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  52.18 
 
 		 627 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  52.08 
 
 		 638 aa  594  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 640 aa  585  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  52.16 
 
 		 654 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  53.48 
 
 		 648 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  52.84 
 
 		 628 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  53.92 
 
 		 627 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  53.54 
 
 		 638 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  52.49 
 
 		 637 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  52.13 
 
 		 620 aa  575  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  52.68 
 
 		 631 aa  569  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.5 
 
 		 614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  52.08 
 
 		 637 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  51.26 
 
 		 659 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  51.84 
 
 		 663 aa  558  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  54.04 
 
 		 632 aa  548  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  42.54 
 
 		 626 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  42.44 
 
 		 628 aa  468  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  41.19 
 
 		 648 aa  462  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 594 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  37.25 
 
 		 593 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  39.14 
 
 		 623 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  37.67 
 
 		 589 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  37.33 
 
 		 607 aa  361  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.22 
 
 		 626 aa  360  3e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.65 
 
 		 608 aa  359  7e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  34.62 
 
 		 611 aa  359  9e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.83 
 
 		 671 aa  356  8.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.13 
 
 		 614 aa  355  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  35.97 
 
 		 635 aa  353  5.9999999999999994e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  38.27 
 
 		 613 aa  350  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.45 
 
 		 598 aa  344  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.59 
 
 		 613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.23 
 
 		 601 aa  336  7e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  32.31 
 
 		 600 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  32.06 
 
 		 618 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.2 
 
 		 597 aa  327  5e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.33 
 
 		 597 aa  326  7e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  31.65 
 
 		 598 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.33 
 
 		 597 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.79 
 
 		 602 aa  325  1e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  32.43 
 
 		 592 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.51 
 
 		 585 aa  320  6e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 600 aa  320  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  32.05 
 
 		 586 aa  319  9e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1595  ABC transporter related  35.5 
 
 		 670 aa  319  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.12327  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  33.99 
 
 		 606 aa  319  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  32.91 
 
 		 635 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.77 
 
 		 586 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  30.9 
 
 		 586 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  32.89 
 
 		 601 aa  317  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  30.78 
 
 		 587 aa  317  6e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  31.46 
 
 		 617 aa  316  8e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.24 
 
 		 597 aa  316  8e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.77 
 
 		 586 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  31.46 
 
 		 607 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  37.26 
 
 		 653 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  31.48 
 
 		 622 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  35.97 
 
 		 600 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1666  ABC transporter related  33.28 
 
 		 665 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.6 
 
 		 586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  32.02 
 
 		 587 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 		 571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.6 
 
 		 586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  32.57 
 
 		 593 aa  315  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 		 571 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 598 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 586 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.77 
 
 		 586 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  29.38 
 
 		 594 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 586 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  32.05 
 
 		 614 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.77 
 
 		 586 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.77 
 
 		 586 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  31.74 
 
 		 607 aa  313  7.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>