More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1666 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1595  ABC transporter related  72.73 
 
 		 670 aa  865    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.12327  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1666  ABC transporter related  100 
 
 		 665 aa  1300    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5582  ABC transporter related  39.83 
 
 		 803 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0235423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  37.72 
 
 		 636 aa  353  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  39.35 
 
 		 632 aa  348  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  37.85 
 
 		 638 aa  346  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 622 aa  343  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  37.48 
 
 		 640 aa  342  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  40.55 
 
 		 658 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  35.93 
 
 		 627 aa  337  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  40.73 
 
 		 658 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  36.09 
 
 		 648 aa  332  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 624 aa  330  7e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  37.85 
 
 		 642 aa  328  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  36.64 
 
 		 641 aa  327  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.83 
 
 		 622 aa  324  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  36.95 
 
 		 632 aa  324  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  38.83 
 
 		 626 aa  323  7e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  36.41 
 
 		 687 aa  321  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.58 
 
 		 634 aa  320  7e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  34.11 
 
 		 628 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 640 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  37.19 
 
 		 639 aa  314  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  36.56 
 
 		 635 aa  313  4.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.46 
 
 		 614 aa  311  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  35.76 
 
 		 622 aa  310  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  37.5 
 
 		 637 aa  310  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  37.48 
 
 		 642 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  37.46 
 
 		 631 aa  306  6e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  34.27 
 
 		 648 aa  306  6e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  36.81 
 
 		 624 aa  302  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  37.54 
 
 		 635 aa  301  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  38.59 
 
 		 620 aa  301  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  35.52 
 
 		 631 aa  301  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  36.48 
 
 		 663 aa  299  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  37.12 
 
 		 637 aa  298  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  36.66 
 
 		 627 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  35.8 
 
 		 648 aa  297  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  35.83 
 
 		 593 aa  296  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 632 aa  296  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  37.66 
 
 		 638 aa  294  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  33.17 
 
 		 626 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  35.67 
 
 		 638 aa  292  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  34.4 
 
 		 654 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.39 
 
 		 627 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  34.84 
 
 		 659 aa  287  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  34.79 
 
 		 594 aa  286  8e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  36.23 
 
 		 628 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  32.64 
 
 		 627 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  32.64 
 
 		 627 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  35.56 
 
 		 607 aa  283  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  33.49 
 
 		 589 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  36.85 
 
 		 613 aa  280  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  31.88 
 
 		 623 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.21 
 
 		 614 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  29.14 
 
 		 602 aa  268  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  32.11 
 
 		 610 aa  263  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  30.72 
 
 		 611 aa  263  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  27.12 
 
 		 597 aa  259  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.25 
 
 		 608 aa  256  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.95 
 
 		 613 aa  253  7e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3782  hypothetical protein  32.86 
 
 		 593 aa  253  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.245916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.94 
 
 		 626 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.44 
 
 		 592 aa  250  6e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.91 
 
 		 578 aa  250  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.91 
 
 		 578 aa  250  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.73 
 
 		 578 aa  249  9e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  30.7 
 
 		 635 aa  249  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.98 
 
 		 721 aa  249  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.79 
 
 		 598 aa  248  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  32.37 
 
 		 601 aa  248  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  31.67 
 
 		 584 aa  248  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  33.06 
 
 		 595 aa  247  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  30.05 
 
 		 578 aa  246  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.02 
 
 		 556 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  30.31 
 
 		 550 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  33.28 
 
 		 606 aa  246  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  32.1 
 
 		 636 aa  245  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.06 
 
 		 574 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.54 
 
 		 589 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  28.26 
 
 		 598 aa  244  3.9999999999999997e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.06 
 
 		 574 aa  244  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  30.06 
 
 		 600 aa  244  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  31.47 
 
 		 582 aa  244  5e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  31.36 
 
 		 655 aa  244  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  33 
 
 		 640 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  28.41 
 
 		 578 aa  243  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  31.78 
 
 		 575 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  32.06 
 
 		 606 aa  242  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.74 
 
 		 628 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  30.81 
 
 		 597 aa  243  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.4 
 
 		 628 aa  242  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.23 
 
 		 625 aa  242  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  30.66 
 
 		 582 aa  242  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  26.32 
 
 		 598 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  30.56 
 
 		 590 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  30.36 
 
 		 572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3324  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.85 
 
 		 680 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51627  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.92 
 
 		 580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.85 
 
 		 598 aa  241  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>