More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3324 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  67.37 
 
 		 644 aa  868    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  64.45 
 
 		 593 aa  769    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  72.35 
 
 		 620 aa  957    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  55.4 
 
 		 582 aa  680    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3324  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  100 
 
 		 680 aa  1378    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  67.37 
 
 		 644 aa  866    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  75.07 
 
 		 637 aa  1008    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  67.22 
 
 		 634 aa  866    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  78.95 
 
 		 617 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  70.56 
 
 		 634 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  72.9 
 
 		 613 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  72.06 
 
 		 595 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  72.61 
 
 		 613 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  73.97 
 
 		 613 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  76.3 
 
 		 606 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  70.53 
 
 		 618 aa  534  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.17 
 
 		 601 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.43 
 
 		 605 aa  492  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.69 
 
 		 590 aa  463  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.16 
 
 		 586 aa  452  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  40.43 
 
 		 594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0078  ABC transporter related  40.57 
 
 		 643 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.503479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  43.65 
 
 		 589 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  58.7 
 
 		 593 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  41.78 
 
 		 589 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  37.89 
 
 		 601 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  38.64 
 
 		 611 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  41.78 
 
 		 600 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38 
 
 		 600 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.24 
 
 		 622 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.08 
 
 		 618 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.33 
 
 		 598 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  49.59 
 
 		 625 aa  365  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1985  ABC transporter related  36.42 
 
 		 597 aa  362  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.384542  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.52 
 
 		 601 aa  361  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0690  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  32.24 
 
 		 581 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.212037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49970  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  49.12 
 
 		 588 aa  339  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0923957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.35 
 
 		 618 aa  333  5e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3622  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.61 
 
 		 587 aa  331  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2021  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.84 
 
 		 589 aa  329  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.47227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.01 
 
 		 597 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1659  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.2 
 
 		 600 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4256  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  50 
 
 		 588 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2119  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.15 
 
 		 587 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.38 
 
 		 587 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1636  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.67 
 
 		 568 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  34.54 
 
 		 611 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  32.39 
 
 		 601 aa  310  8e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  34.24 
 
 		 611 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.24 
 
 		 611 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  43.61 
 
 		 586 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.01 
 
 		 598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  35.09 
 
 		 611 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.87 
 
 		 583 aa  303  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  30.26 
 
 		 588 aa  303  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  43.06 
 
 		 586 aa  302  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  31.48 
 
 		 614 aa  298  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.19 
 
 		 580 aa  298  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.08 
 
 		 580 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  29.04 
 
 		 635 aa  293  9e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  30.55 
 
 		 645 aa  291  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.72 
 
 		 580 aa  291  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  31.9 
 
 		 589 aa  290  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  31.93 
 
 		 594 aa  284  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  28.44 
 
 		 636 aa  283  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  29.68 
 
 		 607 aa  283  9e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1736  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.36 
 
 		 616 aa  280  9e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  30.37 
 
 		 571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  31.36 
 
 		 606 aa  274  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  29.43 
 
 		 636 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  28.93 
 
 		 602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.52 
 
 		 572 aa  270  8.999999999999999e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  30.52 
 
 		 572 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  32.84 
 
 		 578 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  57.94 
 
 		 619 aa  269  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.86 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  30.52 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.89 
 
 		 650 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.76 
 
 		 608 aa  268  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  28.55 
 
 		 578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  30.61 
 
 		 566 aa  267  5e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  28.46 
 
 		 610 aa  267  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.48 
 
 		 587 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0822  ABC transporter related  28.68 
 
 		 640 aa  266  8.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0882213  hitchhiker  0.0000266707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  27.81 
 
 		 611 aa  266  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  29.1 
 
 		 580 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.06 
 
 		 637 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  29.45 
 
 		 604 aa  265  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  57.21 
 
 		 597 aa  265  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  30.64 
 
 		 660 aa  265  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  29.31 
 
 		 628 aa  264  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  30.76 
 
 		 584 aa  264  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  30.26 
 
 		 582 aa  263  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  57.76 
 
 		 616 aa  263  8.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.74 
 
 		 583 aa  262  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.15 
 
 		 590 aa  262  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  28.89 
 
 		 603 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  56.77 
 
 		 614 aa  261  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.53 
 
 		 632 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.5 
 
 		 639 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>