More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1595 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1595  ABC transporter related  100 
 
 		 670 aa  1303    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.12327  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1666  ABC transporter related  73.64 
 
 		 665 aa  891    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  41.19 
 
 		 658 aa  345  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  37.91 
 
 		 636 aa  343  5e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  38.99 
 
 		 627 aa  343  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 622 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  41.37 
 
 		 658 aa  340  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  37.93 
 
 		 638 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  38.86 
 
 		 632 aa  334  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  37.42 
 
 		 640 aa  333  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  37.89 
 
 		 641 aa  332  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.24 
 
 		 622 aa  330  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  37.72 
 
 		 648 aa  328  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.04 
 
 		 634 aa  326  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 642 aa  326  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  36.14 
 
 		 648 aa  325  1e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  38.73 
 
 		 632 aa  325  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 624 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  37.88 
 
 		 642 aa  323  7e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  37.66 
 
 		 687 aa  323  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  39.28 
 
 		 635 aa  320  7e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  34.55 
 
 		 628 aa  319  9e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  38.91 
 
 		 626 aa  319  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  38.41 
 
 		 627 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  37.06 
 
 		 631 aa  311  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  38.53 
 
 		 639 aa  311  4e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  38.23 
 
 		 635 aa  307  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  38.45 
 
 		 622 aa  306  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  36.18 
 
 		 640 aa  304  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  37.99 
 
 		 593 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  38.16 
 
 		 624 aa  302  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  37.46 
 
 		 663 aa  302  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  37.96 
 
 		 594 aa  300  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.54 
 
 		 614 aa  299  9e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  35.92 
 
 		 589 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  36.78 
 
 		 631 aa  295  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  36.11 
 
 		 638 aa  294  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  36.23 
 
 		 659 aa  294  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  34.68 
 
 		 654 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  36.18 
 
 		 637 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  37.82 
 
 		 620 aa  291  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  36.28 
 
 		 632 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  37.66 
 
 		 637 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  34.14 
 
 		 626 aa  290  7e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  37.21 
 
 		 638 aa  289  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  36.85 
 
 		 628 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  35.5 
 
 		 648 aa  283  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.41 
 
 		 627 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  35.57 
 
 		 607 aa  281  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.36 
 
 		 613 aa  280  5e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  33.6 
 
 		 627 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  33.6 
 
 		 627 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  33.55 
 
 		 623 aa  278  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  32.7 
 
 		 611 aa  278  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  33.91 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 613 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.48 
 
 		 602 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.59 
 
 		 626 aa  267  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  34.57 
 
 		 590 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.5 
 
 		 597 aa  266  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5582  ABC transporter related  62.1 
 
 		 803 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0235423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.43 
 
 		 589 aa  261  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.02 
 
 		 556 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.37 
 
 		 608 aa  260  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.67 
 
 		 578 aa  260  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.67 
 
 		 578 aa  260  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.63 
 
 		 586 aa  259  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  30.88 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.16 
 
 		 632 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  33.44 
 
 		 591 aa  259  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.1 
 
 		 614 aa  258  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  33.96 
 
 		 567 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.22 
 
 		 592 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  34.68 
 
 		 591 aa  257  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.5 
 
 		 586 aa  256  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  31.6 
 
 		 589 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.62 
 
 		 601 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.5 
 
 		 586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  33.99 
 
 		 598 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.62 
 
 		 567 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.3 
 
 		 586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  32.34 
 
 		 550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.06 
 
 		 598 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.5 
 
 		 586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3782  hypothetical protein  32.95 
 
 		 593 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.245916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.5 
 
 		 586 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  33.82 
 
 		 598 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.1 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.09 
 
 		 578 aa  254  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.17 
 
 		 702 aa  254  5.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.1 
 
 		 610 aa  254  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.1 
 
 		 610 aa  254  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  33.66 
 
 		 590 aa  253  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  29.34 
 
 		 586 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.34 
 
 		 586 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.5 
 
 		 586 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  30.2 
 
 		 586 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  31.07 
 
 		 600 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  33.82 
 
 		 594 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  33.82 
 
 		 596 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>