More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1697 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  58.64 
 
 		 636 aa  651    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  68.86 
 
 		 637 aa  797    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  100 
 
 		 631 aa  1223    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  60.27 
 
 		 687 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  77.62 
 
 		 627 aa  904    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  59.57 
 
 		 642 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  66.45 
 
 		 622 aa  779    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  72.22 
 
 		 632 aa  798    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  69.28 
 
 		 622 aa  803    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  74.64 
 
 		 638 aa  851    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  59.73 
 
 		 640 aa  671    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  57.77 
 
 		 641 aa  653    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  72.93 
 
 		 654 aa  861    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  61.36 
 
 		 658 aa  665    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  58.66 
 
 		 624 aa  641    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  69.18 
 
 		 627 aa  812    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  70.24 
 
 		 637 aa  834    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  69.18 
 
 		 627 aa  812    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  67.99 
 
 		 663 aa  766    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  68.47 
 
 		 640 aa  800    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  75.68 
 
 		 628 aa  875    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  65.73 
 
 		 614 aa  734    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  69.29 
 
 		 626 aa  818    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  68.85 
 
 		 659 aa  778    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  61.45 
 
 		 632 aa  699    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  61.76 
 
 		 658 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  68.52 
 
 		 620 aa  751    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  57.86 
 
 		 642 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  70.57 
 
 		 648 aa  763    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  57.28 
 
 		 638 aa  631  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  57.56 
 
 		 648 aa  631  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  55.05 
 
 		 622 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  54.05 
 
 		 627 aa  619  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.13 
 
 		 634 aa  610  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  56.75 
 
 		 639 aa  608  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  57.36 
 
 		 632 aa  606  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  56.13 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  54.91 
 
 		 627 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  52.68 
 
 		 631 aa  554  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  54.35 
 
 		 624 aa  548  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  51.79 
 
 		 638 aa  538  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  44.03 
 
 		 628 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  39.91 
 
 		 648 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  44.78 
 
 		 626 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 623 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.92 
 
 		 671 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  39.25 
 
 		 593 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  39.97 
 
 		 594 aa  358  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  34.43 
 
 		 611 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.81 
 
 		 613 aa  341  2e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.25 
 
 		 598 aa  340  5.9999999999999996e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  37.77 
 
 		 635 aa  337  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  39.46 
 
 		 607 aa  337  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.07 
 
 		 597 aa  337  5e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.44 
 
 		 586 aa  336  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.07 
 
 		 597 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.77 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.77 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.61 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  32.77 
 
 		 586 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.77 
 
 		 586 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.61 
 
 		 586 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.55 
 
 		 586 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.72 
 
 		 586 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.59 
 
 		 602 aa  332  1e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  32.38 
 
 		 586 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  36.52 
 
 		 601 aa  331  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.05 
 
 		 571 aa  330  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.88 
 
 		 571 aa  329  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.88 
 
 		 571 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.88 
 
 		 571 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.88 
 
 		 571 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.88 
 
 		 571 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.88 
 
 		 571 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.88 
 
 		 571 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.16 
 
 		 586 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 613 aa  325  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.72 
 
 		 617 aa  324  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  34.22 
 
 		 617 aa  323  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.94 
 
 		 577 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.65 
 
 		 578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.55 
 
 		 571 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.13 
 
 		 571 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.65 
 
 		 578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.47 
 
 		 608 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1666  ABC transporter related  37.46 
 
 		 665 aa  320  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  36.23 
 
 		 600 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  37.44 
 
 		 607 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.93 
 
 		 578 aa  317  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  30.83 
 
 		 598 aa  317  5e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.86 
 
 		 585 aa  317  6e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.65 
 
 		 582 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  33.71 
 
 		 590 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.65 
 
 		 582 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  35.85 
 
 		 589 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.65 
 
 		 582 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  30.96 
 
 		 631 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30.9 
 
 		 584 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  34.08 
 
 		 580 aa  313  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  30.25 
 
 		 590 aa  313  7.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>