More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3402 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  65.48 
 
 
642 aa  755    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  57.56 
 
 
639 aa  657    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  59.22 
 
 
632 aa  698    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  71.29 
 
 
627 aa  866    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  58.5 
 
 
627 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  59.13 
 
 
687 aa  709    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  55.92 
 
 
642 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  56.14 
 
 
628 aa  638    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.52 
 
 
622 aa  668    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  58.31 
 
 
641 aa  694    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  58.48 
 
 
638 aa  647    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  63.67 
 
 
636 aa  751    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  55.48 
 
 
640 aa  656    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  57.12 
 
 
627 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  56.19 
 
 
622 aa  637    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  57.47 
 
 
658 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  59.9 
 
 
638 aa  693    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  59.44 
 
 
648 aa  672    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  62.44 
 
 
624 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  100 
 
 
622 aa  1229    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  60.16 
 
 
627 aa  665    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  57.12 
 
 
627 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  57.39 
 
 
626 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.35 
 
 
634 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  57.45 
 
 
658 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  54.8 
 
 
632 aa  631  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  58.33 
 
 
638 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  57.33 
 
 
635 aa  631  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  56.37 
 
 
624 aa  629  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  53.47 
 
 
631 aa  620  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  55.54 
 
 
631 aa  618  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  53.59 
 
 
637 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  55.22 
 
 
640 aa  611  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  55.78 
 
 
620 aa  607  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  54.13 
 
 
637 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  57.12 
 
 
648 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  53.36 
 
 
654 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  55.71 
 
 
659 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  55.87 
 
 
663 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.91 
 
 
614 aa  588  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  56.31 
 
 
632 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  45.45 
 
 
648 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  45.87 
 
 
628 aa  525  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  45.92 
 
 
626 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  41.65 
 
 
594 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  40.5 
 
 
623 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  41.44 
 
 
593 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.81 
 
 
671 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  36.54 
 
 
611 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  40.4 
 
 
635 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  39.51 
 
 
607 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.05 
 
 
626 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  38.57 
 
 
589 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.75 
 
 
598 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.97 
 
 
613 aa  369  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
613 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.56 
 
 
627 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.5 
 
 
597 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.5 
 
 
597 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  34.23 
 
 
586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.59 
 
 
608 aa  357  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.89 
 
 
586 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.78 
 
 
601 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.5 
 
 
606 aa  353  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.06 
 
 
586 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.23 
 
 
586 aa  351  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.23 
 
 
586 aa  351  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  34.23 
 
 
586 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.95 
 
 
586 aa  350  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.23 
 
 
586 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.72 
 
 
586 aa  349  7e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.46 
 
 
614 aa  349  9e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1666  ABC transporter related  36.64 
 
 
665 aa  348  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 
586 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.81 
 
 
597 aa  345  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  37.76 
 
 
601 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.5 
 
 
572 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  35.06 
 
 
597 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.5 
 
 
579 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.59 
 
 
582 aa  342  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.59 
 
 
582 aa  342  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.59 
 
 
582 aa  342  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.95 
 
 
617 aa  340  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.76 
 
 
578 aa  336  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.76 
 
 
578 aa  336  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  33.75 
 
 
635 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.45 
 
 
585 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.94 
 
 
594 aa  333  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  34.29 
 
 
582 aa  332  9e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.29 
 
 
582 aa  332  9e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.29 
 
 
582 aa  332  9e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.29 
 
 
582 aa  332  9e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.29 
 
 
582 aa  332  9e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.29 
 
 
582 aa  332  9e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.29 
 
 
582 aa  332  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  33.12 
 
 
607 aa  332  9e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.29 
 
 
582 aa  332  9e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  34.29 
 
 
582 aa  332  9e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1595  ABC transporter related  36.5 
 
 
670 aa  332  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.12327  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  37.13 
 
 
575 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>