More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1305 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  72.23 
 
 		 637 aa  843    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  63.3 
 
 		 658 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  74.64 
 
 		 631 aa  867    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.14 
 
 		 634 aa  640    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  60.67 
 
 		 638 aa  669    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  59.83 
 
 		 636 aa  672    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  73.1 
 
 		 654 aa  865    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  57.44 
 
 		 641 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  77.08 
 
 		 628 aa  909    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  81.26 
 
 		 627 aa  944    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  70.18 
 
 		 627 aa  848    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  71.36 
 
 		 622 aa  836    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  63.55 
 
 		 632 aa  733    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  60.65 
 
 		 642 aa  716    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 622 aa  647    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  71.47 
 
 		 637 aa  848    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 640 aa  729    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  60.07 
 
 		 624 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  59.19 
 
 		 648 aa  659    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  57.72 
 
 		 627 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  70.18 
 
 		 627 aa  848    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  68.08 
 
 		 663 aa  770    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  67.98 
 
 		 614 aa  774    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  76.69 
 
 		 632 aa  850    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  71.15 
 
 		 640 aa  821    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  59.51 
 
 		 687 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  70.61 
 
 		 626 aa  855    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  66.25 
 
 		 659 aa  780    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  68.65 
 
 		 622 aa  816    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  61.59 
 
 		 658 aa  682    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  60.16 
 
 		 642 aa  667    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  69.97 
 
 		 648 aa  775    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  100 
 
 		 638 aa  1241    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  69.59 
 
 		 620 aa  783    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  58.73 
 
 		 639 aa  630  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  56.41 
 
 		 632 aa  616  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  52.44 
 
 		 627 aa  612  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  56.76 
 
 		 635 aa  600  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  53.54 
 
 		 631 aa  571  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  54.52 
 
 		 624 aa  566  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  52.55 
 
 		 638 aa  558  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  45.63 
 
 		 628 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  42.83 
 
 		 648 aa  505  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  47.45 
 
 		 626 aa  488  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  41.44 
 
 		 623 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.35 
 
 		 671 aa  411  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  39.33 
 
 		 593 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 594 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  38.2 
 
 		 635 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.76 
 
 		 601 aa  360  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  34.6 
 
 		 611 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.36 
 
 		 613 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.14 
 
 		 598 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.05 
 
 		 577 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.89 
 
 		 571 aa  350  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  40.07 
 
 		 607 aa  350  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.89 
 
 		 571 aa  350  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.89 
 
 		 571 aa  350  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.89 
 
 		 571 aa  350  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.89 
 
 		 571 aa  350  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.89 
 
 		 571 aa  350  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  34.39 
 
 		 586 aa  349  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.06 
 
 		 608 aa  349  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 		 586 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.72 
 
 		 586 aa  349  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.39 
 
 		 586 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  34.39 
 
 		 586 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 		 586 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 		 586 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 		 586 aa  347  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.27 
 
 		 571 aa  347  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.27 
 
 		 571 aa  347  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.39 
 
 		 586 aa  347  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  37.25 
 
 		 589 aa  346  8e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 		 586 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.55 
 
 		 571 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.76 
 
 		 571 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 613 aa  340  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  36.65 
 
 		 614 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  34.33 
 
 		 617 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.96 
 
 		 585 aa  333  5e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.89 
 
 		 597 aa  333  8e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.89 
 
 		 597 aa  333  8e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.96 
 
 		 626 aa  331  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.5 
 
 		 586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  36.29 
 
 		 590 aa  325  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  31.12 
 
 		 631 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.77 
 
 		 584 aa  324  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35.6 
 
 		 625 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.72 
 
 		 572 aa  323  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.93 
 
 		 578 aa  323  7e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.93 
 
 		 578 aa  323  7e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  33.96 
 
 		 580 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.08 
 
 		 702 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  36.94 
 
 		 575 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  32.16 
 
 		 584 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.78 
 
 		 598 aa  321  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.55 
 
 		 618 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.93 
 
 		 578 aa  320  5e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  29.5 
 
 		 618 aa  320  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>