More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0187 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  60.62 
 
 		 624 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  63.47 
 
 		 631 aa  732    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  57.07 
 
 		 628 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  58.06 
 
 		 627 aa  664    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  57.53 
 
 		 622 aa  635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  58.7 
 
 		 658 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  57.33 
 
 		 640 aa  659    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  72.33 
 
 		 634 aa  879    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  64.63 
 
 		 641 aa  750    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  56.67 
 
 		 638 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  100 
 
 		 632 aa  1235    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  59.65 
 
 		 638 aa  706    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  73.29 
 
 		 624 aa  831    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  59.52 
 
 		 642 aa  698    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  58.33 
 
 		 622 aa  659    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  61.53 
 
 		 648 aa  711    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  62.44 
 
 		 642 aa  738    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  75.49 
 
 		 635 aa  842    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  60.83 
 
 		 636 aa  717    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  54.68 
 
 		 622 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  64.6 
 
 		 687 aa  747    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  60.58 
 
 		 639 aa  672    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  59.54 
 
 		 658 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  60.69 
 
 		 632 aa  696    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  58.38 
 
 		 640 aa  628  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  56.62 
 
 		 627 aa  631  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  56.2 
 
 		 654 aa  628  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  58.75 
 
 		 648 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  56.5 
 
 		 626 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  57.57 
 
 		 627 aa  621  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  56.07 
 
 		 627 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  56.41 
 
 		 638 aa  618  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  56.07 
 
 		 627 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  57.36 
 
 		 631 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  56.16 
 
 		 663 aa  596  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.44 
 
 		 614 aa  594  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  56.09 
 
 		 620 aa  593  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  56 
 
 		 637 aa  592  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  55.03 
 
 		 659 aa  587  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  53.06 
 
 		 637 aa  584  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  56.06 
 
 		 632 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  45.18 
 
 		 628 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  40.63 
 
 		 648 aa  480  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  44.67 
 
 		 626 aa  477  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  42.74 
 
 		 593 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  42.32 
 
 		 635 aa  418  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  42.26 
 
 		 594 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 623 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.97 
 
 		 671 aa  395  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  34.67 
 
 		 611 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  40.07 
 
 		 589 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.66 
 
 		 613 aa  382  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  42.93 
 
 		 613 aa  382  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.03 
 
 		 626 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.96 
 
 		 598 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  40.65 
 
 		 607 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.92 
 
 		 601 aa  352  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.24 
 
 		 602 aa  347  4e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  35.02 
 
 		 597 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.29 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.67 
 
 		 586 aa  335  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.13 
 
 		 586 aa  334  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.29 
 
 		 586 aa  333  5e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.99 
 
 		 579 aa  333  6e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1666  ABC transporter related  36.95 
 
 		 665 aa  333  7.000000000000001e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.29 
 
 		 608 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.06 
 
 		 598 aa  331  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.13 
 
 		 586 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.13 
 
 		 586 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.19 
 
 		 586 aa  331  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  31.41 
 
 		 586 aa  330  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.46 
 
 		 586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  31.13 
 
 		 586 aa  329  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.13 
 
 		 586 aa  329  8e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.62 
 
 		 582 aa  329  8e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 636 aa  328  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.11 
 
 		 577 aa  327  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.45 
 
 		 597 aa  327  6e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.45 
 
 		 578 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  36.09 
 
 		 600 aa  325  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 		 582 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.81 
 
 		 614 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 		 582 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 		 582 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 		 582 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 		 582 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  34.49 
 
 		 600 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  30.64 
 
 		 597 aa  325  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  30.64 
 
 		 597 aa  324  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.78 
 
 		 578 aa  323  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.78 
 
 		 578 aa  323  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  33.55 
 
 		 582 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.55 
 
 		 582 aa  323  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.55 
 
 		 582 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.55 
 
 		 582 aa  323  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.55 
 
 		 582 aa  323  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1595  ABC transporter related  38.79 
 
 		 670 aa  323  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.12327  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.55 
 
 		 582 aa  323  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.55 
 
 		 582 aa  323  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  33.55 
 
 		 582 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>