More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2462 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  57.1 
 
 		 632 aa  664    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  57.4 
 
 		 658 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  60.93 
 
 		 624 aa  707    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  57.58 
 
 		 639 aa  661    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  58.5 
 
 		 627 aa  677    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  60.96 
 
 		 636 aa  724    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.16 
 
 		 634 aa  656    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  58.08 
 
 		 641 aa  688    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  100 
 
 		 638 aa  1278    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  65.26 
 
 		 642 aa  760    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  58.48 
 
 		 622 aa  674    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  58.95 
 
 		 648 aa  667    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  54.62 
 
 		 642 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  57.23 
 
 		 687 aa  686    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  58.08 
 
 		 632 aa  680    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  60.22 
 
 		 638 aa  721    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  57.24 
 
 		 627 aa  619  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  55.99 
 
 		 658 aa  615  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  51.56 
 
 		 640 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  55.09 
 
 		 624 aa  609  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  55.14 
 
 		 635 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  52.18 
 
 		 631 aa  601  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  52.93 
 
 		 622 aa  597  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  53.28 
 
 		 628 aa  595  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53 
 
 		 622 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  53.04 
 
 		 640 aa  578  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  50.34 
 
 		 626 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  51.38 
 
 		 648 aa  565  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  52.55 
 
 		 638 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  53.27 
 
 		 620 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  50.99 
 
 		 654 aa  564  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  52.15 
 
 		 627 aa  558  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  50.08 
 
 		 627 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  50.08 
 
 		 627 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  51.79 
 
 		 631 aa  551  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.84 
 
 		 614 aa  550  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  48.34 
 
 		 637 aa  548  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  50 
 
 		 637 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  51.1 
 
 		 659 aa  548  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  50.51 
 
 		 663 aa  531  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  52.37 
 
 		 632 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  43.04 
 
 		 648 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  45.47 
 
 		 626 aa  487  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  45.5 
 
 		 628 aa  481  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  39.3 
 
 		 623 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.27 
 
 		 671 aa  423  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.29 
 
 		 626 aa  382  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  38.46 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  37.56 
 
 		 593 aa  379  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  37.36 
 
 		 635 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  38.61 
 
 		 613 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  35.26 
 
 		 611 aa  364  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 598 aa  360  5e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.94 
 
 		 586 aa  360  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  34.72 
 
 		 586 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.11 
 
 		 586 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.81 
 
 		 613 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 586 aa  357  5e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.94 
 
 		 586 aa  357  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.94 
 
 		 586 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.94 
 
 		 586 aa  356  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33.94 
 
 		 586 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.94 
 
 		 586 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.61 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.95 
 
 		 577 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.6 
 
 		 586 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  37.48 
 
 		 607 aa  347  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  35.97 
 
 		 627 aa  339  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  34.53 
 
 		 597 aa  338  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  31.13 
 
 		 582 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.89 
 
 		 585 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.61 
 
 		 579 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.67 
 
 		 636 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.09 
 
 		 597 aa  331  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  33.44 
 
 		 582 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.44 
 
 		 582 aa  330  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.44 
 
 		 582 aa  330  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.44 
 
 		 582 aa  330  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.44 
 
 		 582 aa  330  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.44 
 
 		 582 aa  330  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.44 
 
 		 582 aa  330  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.44 
 
 		 582 aa  330  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.49 
 
 		 608 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  33.44 
 
 		 582 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.81 
 
 		 601 aa  329  8e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.1 
 
 		 582 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  32.17 
 
 		 587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.9 
 
 		 602 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.79 
 
 		 597 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.4 
 
 		 578 aa  326  9e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.4 
 
 		 578 aa  326  9e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.94 
 
 		 582 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  35.03 
 
 		 635 aa  325  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.94 
 
 		 582 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.94 
 
 		 582 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.94 
 
 		 582 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  35.43 
 
 		 606 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.22 
 
 		 572 aa  326  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.16 
 
 		 587 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>